RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 PIK3R2O00459 728 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 KCNK3O14649 394 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 KIF19Q2TAC6 998 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CBWD6Q4V339 395 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 FAM217AQ8IXS0 508 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.15■□□□□ 0.82
UBXN4-202ENST00000415164 FAM47DPA6NHR8 397 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 FLRT2O43155 660 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TBL1XO60907 577 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 SEMA4FO95754 770 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 IGLV3-19P01714 112 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 RGS7P49802 495 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 SGSHP51688 502 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 IL9RQ01113 521 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CUL2Q13617 745 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 EDRF1Q3B7T1 1238 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZCWPW2Q504Y3 356 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 MBLAC2Q68D91 279 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PM20D1Q6GTS8 502 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 BHLHA9Q7RTU4 235 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 MARCH9Q86YJ5 346 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 AHI1Q8N157 1196 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TSG101Q99816 390 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 STIM2Q9P246 746 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ATRXP46100 2492 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF883P0CG24 379 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ACAP1Q15027 740 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 COL28A1Q2UY09 1125 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRF1Q5T601 910 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 GLRX5Q86SX6 157 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CDC6Q99741 560 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM245Q9H330 911 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PRSS16Q9NQE7 514 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC13Q9NSE7 274 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 RAXQ9Y2V3 346 aa20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 DSPP15924 2871 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF202O95125 648 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF445P59923 1031 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 RPS14P62263 151 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ADIPOR2Q86V24 386 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 BIRC7Q96CA5 298 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PCED1AQ9H1Q7 454 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 MTG2Q9H4K7 406 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 GPSM3Q9Y4H4 160 aa20.12■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CAPNS1P04632 268 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 DLDP09622 509 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 SETSIPP0DME0 302 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 VDRP11473 427 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CD70P32970 193 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 SLC11A2P49281 568 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ST8SIA6P61647 398 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PNOCQ13519 176 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PTPRNQ16849 979 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 MFN1Q8IWA4 741 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 C1orf216Q8TAB5 229 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 GOLGA1Q92805 767 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.11■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 FAM149AA5PLN7 773 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 M0QYV0 167 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CCT8P50990 548 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 C21orf59P57076 290 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 DAOAP59103 153 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM270Q6UE05 265 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 PDZD3Q86UT5 571 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CARNMT1Q8N4J0 409 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 FBRSQ9HAH7 460 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 CNGB3Q9NQW8 809 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
UBXN4-202ENST00000415164 SUN2Q9UH99 717 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms