RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415055.2

PTPRK-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-210ENST00000415055 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 IGSF21Q96ID5 467 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM227BQ96M60 508 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LRGUKQ96M69 825 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KLHL5Q96PQ7 755 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SDF4Q9BRK5 362 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 EPS15L1Q9UBC2 864 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ASH2LQ9UBL3 628 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SLC9A2Q9UBY0 812 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NOTCH4Q99466 2003 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ITPR1Q14643 2758 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NUP205Q92621 2012 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FRMPD4Q14CM0 1322 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 A0A0D9SFI3 127 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TCRBV5S2A0A599 114 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM90A27PA6NNH2 459 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 HBP1O60381 514 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GLUD1P00367 558 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 URODP06132 367 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RETP07949 1114 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LAMP2P13473 410 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RPL17P18621 184 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FGFR4P22455 802 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KIF5BP33176 963 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GPR15P49685 360 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CLCN3P51790 818 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NEK3P51956 506 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ACTR2P61160 394 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 HTR4Q13639 388 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MUM1Q2TAK8 710 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TMEM95Q3KNT9 176 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM160B1Q5W0V3 765 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GLB1LQ6UWU2 654 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PALB2Q86YC2 1186 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CMIPQ8IY22 773 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ABCA7Q8IZY2 2146 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LPPQ93052 612 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MVB12AQ96EY5 273 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MAP7D2Q96T17 732 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PCYT2Q99447 389 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FOXB1Q99853 325 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 KXD1Q9BQD3 176 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 RIC8BQ9NVN3 520 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 DPP7Q9UHL4 492 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MAD2L2Q9UI95 211 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PHTF1Q9UMS5 762 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 APC2O95996 2303 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 URB1O60287 2271 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GOLGA6L22H0YM25 854 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TPP1O14773 563 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LRP3O75074 770 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TUSC2O75896 110 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GALTP07902 379 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TNFRSF1AP19438 455 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MX1P20591 662 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PDCP20941 246 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 C5AR1P21730 350 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MAGEA9P43362 315 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SLC11A1P49279 550 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SHC2P98077 582 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
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PTPRK-210ENST00000415055 ROM1Q03395 351 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 MTAPQ13126 283 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 GALEQ14376 348 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 WTAPQ15007 396 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CCDC6Q16204 474 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 CSRP2Q16527 193 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 UBE2SQ16763 222 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PRR16Q569H4 304 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TOR2AQ5JU69 321 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 ZNF484Q5JVG2 852 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 LRSAM1Q6UWE0 723 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 PARM1Q6UWI2 310 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRK-210ENST00000415055 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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