RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410938.1

RNU6-1328P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1328, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1328P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1328P-201ENST00000410938 VEPH1Q14D04 833 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KCNMB1Q16558 191 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF827Q17R98 1081 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EDRF1Q3B7T1 1238 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF766Q5HY98 468 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCDC158Q5M9N0 1113 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CDC73Q6P1J9 531 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TAF2Q6P1X5 1199 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF449Q6P9G9 518 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NCEH1Q6PIU2 408 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CHST9Q7L1S5 443 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ADCK2Q7Z695 626 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CLNKQ7Z7G1 428 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CEP97Q8IW35 865 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SCN4BQ8IWT1 228 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RHOT2Q8IXI1 618 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GHDCQ8N2G8 530 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LRRC71Q8N4P6 559 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WDTC1Q8N5D0 677 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RNF169Q8NCN4 708 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OR6J1Q8NGC5 347 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PSMA8Q8TAA3 256 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CREB3L4Q8TEY5 395 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NSMCE1Q8WV22 266 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SHISA4Q96DD7 197 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CCDC114Q96M63 670 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FERMT1Q9BQL6 677 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C17orf80Q9BSJ5 609 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DESI2Q9BSY9 194 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MECRQ9BV79 373 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TLR10Q9BXR5 811 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TPSD1Q9BZJ3 242 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TRIM31Q9BZY9 425 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 KLHL4Q9C0H6 718 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PDE7BQ9NP56 450 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TPSG1Q9NRR2 321 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BABAM1Q9NWV8 329 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM30AQ9NZY2 134 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NTMQ9P121 344 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SERTAD3Q9UJW9 196 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TMCC3Q9ULS5 477 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DHDHQ9UQ10 334 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CTNND2Q9UQB3 1225 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FLT1P17948 1338 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 LOC100509620A0A075B734 347 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 A6NL46 340 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TTC34A8MYJ7 566 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TEX22C9J3V5 150 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 STX6O43752 255 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 DIAPH2O60879 1101 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPC4O75487 556 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 MLYCDO95822 493 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GPANK1O95872 356 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 WNT11O96014 354 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RB1P06400 928 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ERCC2P18074 760 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC6A2P23975 617 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 GSTM2P28161 218 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 SLC6A4P31645 630 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CXCR5P32302 372 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CSF2RBP32927 897 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TTKP33981 857 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 THBS2P35442 1172 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 CPOXP36551 454 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RGS2P41220 211 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 NDUFV1P49821 464 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PTTG1IPP53801 180 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 PDE1AP54750 535 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 RAC3P60763 192 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 OLR1P78380 273 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 ARHGAP8P85298 464 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 EFNB1P98172 346 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1328P-201ENST00000410938 TUBB3Q13509 450 aa2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms