RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	EPAS1	Q99814	870 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NUP205	Q92621	2012 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	REV3L	O60673	3130 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	KCNN4	O15554	427 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MFSD11	O43934	449 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ADH1A	P07327	375 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	IVD	P26440	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	RBL1	P28749	1068 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ITGA8	P53708	1063 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EPHB3	P54753	998 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SEMA3B	Q13214	749 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DPYS	Q14117	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	LGMN	Q99538	433 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CERS4	Q9HA82	394 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	STK39	Q9UEW8	545 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PLXNA3	P51805	1871 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CREM	Q03060	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PPP2R5D	Q14738	602 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC25	Q86WR0	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TLR9	Q9NR96	1032 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TP73	O15350	636 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ITIH2	P19823	946 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NR2C2	P49116	596 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM193A	P78312	1265 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PWWP2A	Q96N64	755 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HAPLN3	Q96S86	360 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	C2orf78	A6NCI8	922 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DCLK1	O15075	740 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	APOE	P02649	317 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	IRS1	P35568	1242 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	AP1B1	Q10567	949 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ART4	Q93070	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	WHRN	Q9P202	907 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	EYS	Q5T1H1	3165 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MAP2K7	O14733	419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	GRM6	O15303	877 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	COCH	O43405	550 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	C8A	P07357	584 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	SLC2A3	P11169	496 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	ACTN2	P35609	894 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	KCNQ1	P51787	676 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	HECTD3	Q5T447	861 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	NPW	Q8N729	165 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	PSMG2	Q969U7	264 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MYRFL	Q96LU7	910 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	USP29	Q9HBJ7	922 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RAD9B-204	ENST00000409300	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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