RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384540.1

RNU6-601P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 601, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-601P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF479Q96JC4 524 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TMEM204Q9BSN7 226 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 COLEC11Q9BWP8 271 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 MAGEB5Q9BZ81 275 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TRIM2Q9C040 744 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 FZD3Q9NPG1 666 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SELENONQ9NZV5 590 aa3.11□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 POM121BA6NF01 834 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 WNT1P04628 370 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EGR1P18146 543 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CDC25AP30304 524 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARRB2P32121 409 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 GSTM5P46439 218 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 AGTR2P50052 363 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CASP5P51878 434 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 P2RX3P56373 397 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PTGR1Q14914 329 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 LIPMQ5VYY2 423 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ISM2Q6H9L7 571 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DHRS13Q6UX07 377 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DDIASQ8IXT1 998 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PMM1Q92871 262 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CLMNQ96JQ2 1002 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZPBPQ9BS86 351 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PROCRQ9UNN8 238 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CKAP5Q14008 2032 aa3.1□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PRSS44E7EML9 344 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 M0QZQ0 153 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DHHO43323 396 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLC28A2O43868 658 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 NGFRP08138 427 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ALADP13716 330 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 IDEP14735 1019 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 GABRB3P28472 473 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PIK3CBP42338 1070 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF585BQ52M93 769 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 C6orf10Q5SRN2 563 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 RAP1GAP2Q684P5 730 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PDXDC1Q6P996 788 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 C14orf80Q86SX3 495 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 DGKHQ86XP1 1220 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 FAM47BQ8NA70 645 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC150Q8NCX0 1101 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 OR52N4Q8NGI2 321 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 MIB2Q96AX9 1013 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EME1Q96AY2 570 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 SNX27Q96L92 541 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 KCNK9Q9NPC2 374 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ANAPC4Q9UJX5 808 aa3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
RNU6-601P-201ENST00000384540 A6NNC1 897 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KPNA5O15131 536 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PPP6R2O75170 966 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 VIPP01282 170 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 IFNA2P01563 188 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TGFB3P10600 412 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ATF3P18847 181 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CBFBQ13951 182 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 C16orf89Q6UX73 402 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 LRIG3Q6UXM1 1119 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 FBXL14Q8N1E6 418 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 CCDC33Q8N5R6 958 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 LPAR1Q92633 364 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 TIFAQ96CG3 184 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GRAMD1AQ96CP6 724 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GPR78Q96P69 363 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 MEIS3Q99687 375 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 GDF15Q99988 308 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 PAAF1Q9BRP4 392 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.08□□□□□ -1.92
RNU6-601P-201ENST00000384540 ZNF112Q9UJU3 913 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms