RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-204	ENST00000368210	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AMPD1	P23109	780 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MPP3	Q13368	585 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	INPP5A	Q14642	412 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CNGA2	Q16280	664 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DEFB106A	Q8N104	65 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210		F5H5T6	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	POMC	P01189	267 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RRN3	Q9NYV6	651 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PCDHGB4	Q9UN71	923 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	KDELR1	P24390	212 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	EFEMP1	Q12805	493 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	LRRC38	Q5VT99	294 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CDT1	Q9H211	546 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	UBP1	Q9NZI7	540 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MATN2	O00339	956 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	DGKI	O75912	1065 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PSEN2	P49810	448 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	VPS9D1	Q9Y2B5	631 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MFN2	O95140	757 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	NFIC	P08651	508 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ZSCAN5DP	P0CG00	497 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	NR2C2	P49116	596 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RGS21	Q2M5E4	152 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	VANGL2	Q9ULK5	521 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AKR1A1	P14550	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	BGN	P21810	368 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TNFSF9	P41273	254 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ST8SIA6	P61647	398 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	JADE3	Q92613	823 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	APBB2	Q92870	758 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SUPT7L	O94864	414 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RALB	P11234	206 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CCR1	P32246	355 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	IFNA8	P32881	189 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AVPR1A	P37288	418 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	GLRB	P48167	497 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RAB27A	P51159	221 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	AQP5	P55064	265 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	ARHGEF7	Q14155	803 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MTDH	Q86UE4	582 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	NUP93	Q8N1F7	819 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	MREG	Q8N565	214 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.58	□□□□□ -0.23
PTPRK-204	ENST00000368210	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	CFAP99	D6REC4	459 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210		H7C4K7	107 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	RASSF9	O75901	435 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	TOMM70	O94826	608 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	GRK2	P25098	689 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	PTPN7	P35236	360 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	NOMO3	P69849	1222 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	CDH18	Q13634	790 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	TMEM110	Q86TL2	294 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24
PTPRK-204	ENST00000368210	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24

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