RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SERPIND1P05546 499 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ADRB2P07550 413 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MX2P20592 715 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GPD1P21695 349 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAN1A1P33908 653 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RPIAP49247 311 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NCKAP1LP55160 1127 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GSDMDP57764 484 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 BCL2L1Q07817 233 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DAW1Q8N136 415 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF606Q8WXB4 792 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MCEEQ96PE7 176 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DUSP16Q9BY84 665 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ECT2Q9H8V3 914 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GDF3Q9NR23 364 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CLCA2Q9UQC9 943 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RLFQ13129 1914 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MICAL2O94851 1124 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ARSAP15289 507 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KELP23276 732 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 GALK1P51570 392 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 DHCR24Q15392 516 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PHF19Q5T6S3 580 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA0319Q5VV43 1072 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ALS2CLQ60I27 953 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MBLAC2Q68D91 279 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf74Q86VG3 221 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf210Q8IVY1 113 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 IL22RA1Q8N6P7 574 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC63Q8NA47 563 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FNIP2Q9P278 1114 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 LOC285556D6RIA3 1793 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD3A2A2Y4 597 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC78A2IDD5 438 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PTGESO14684 152 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 STX7O15400 261 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PMPCBO75439 489 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAP3K6O95382 1288 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 TRIM14Q14142 442 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FAM187BQ17R55 369 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SYTL3Q4VX76 610 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLFN11Q7Z7L1 901 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC105Q8IYK2 499 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RXFP2Q8WXD0 754 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC2Q96KP1 924 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PARVAQ9NVD7 372 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SOHLH2Q9NX45 425 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-201ENST00000348564 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 E5RJQ4 531 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SGK1O00141 431 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 NARSO43776 548 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 TBX10O75333 385 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF217O75362 1048 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 KATNA1O75449 491 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 PRNPP04156 253 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINA4P29622 427 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 SLC8A1P32418 973 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 HALP42357 657 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF131P52739 623 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 ZXDAP98168 799 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 FOXM1Q08050 763 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK7Q13164 816 aa4.58□□□□□ -1.68
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