RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA35Q5VZE5 725 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 XYLT1Q86Y38 959 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHPFQ8IZ52 775 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFDC5Q8TCV5 224 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 C18orf8Q96DM3 657 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRG3Q99928 467 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD248Q9HCU0 757 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.3■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PQF6 199 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH1A2O94788 518 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 HLA-FP30511 346 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCNN1AP37088 669 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 C2CD6Q53TS8 623 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MPP7Q5T2T1 576 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM215Q68D42 235 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 KBTBD6Q86V97 674 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERICH1Q86X53 443 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 DDIT4Q9NX09 232 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CKAP5Q14008 2032 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPTBN4Q9H254 2564 aa20.29■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP250Q9BV73 2442 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 DCLK1O15075 740 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBL1XO60907 577 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A13Q5J8X5 152 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 HMGB4Q8WW32 186 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADAM33Q9BZ11 813 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CBX8Q9HC52 389 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 COX16Q9P0S2 106 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAD54BQ9Y620 910 aa20.28■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1B0GTH6 734 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNU1A8MYU2 1149 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RETP07949 1114 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOS2P35228 1153 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MATKP42679 507 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS24P62847 133 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ENPP2Q13822 863 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAP1GAP2Q684P5 730 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 SORCS1Q8WY21 1168 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPY6RQ99463 290 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 CIPCQ9C0C6 399 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCB8Q9NUT2 735 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 STIM2Q9P246 746 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 GGA2Q9UJY4 613 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 STON1Q9Y6Q2 735 aa20.27■□□□□ 0.84
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASH3PC4AMC7 463 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 GABRG2P18507 467 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TACR2P21452 398 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TGM1P22735 817 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCR1P32246 355 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 GBP1P32455 592 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CD70P32970 193 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL12RB1P42701 662 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NME3Q13232 169 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLK5Q496M5 336 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 SDE2Q6IQ49 451 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRNP1Q6NT89 227 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LUZP1Q86V48 1076 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHSY1Q86X52 802 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFN1Q8IWA4 741 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGI2Q8N0V4 545 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 UCMAQ8WVF2 138 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERLEC1Q96DZ1 483 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMLNQ96KR4 655 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms