RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF699Q32M78 642 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSIQ5FYB1 569 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC81Q6ZN84 652 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 Q6ZNB5 142 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 UNC93AQ86WB7 457 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CGRRF1Q99675 332 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PANK4Q9NVE7 773 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 FZD4Q9ULV1 537 aa8.24□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 NEMP2A6NFY4 417 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR4O00206 839 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 DLDP09622 509 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SLFN14P0C7P3 912 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 RXRGP48443 463 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CCR5P51681 352 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNA1Q09470 495 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 STAT4Q14765 748 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD6Q15008 389 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK4Q6UW60 755 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 LAYNQ6UX15 382 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 IQCHQ86VS3 1027 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND1CQ8IV53 801 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PLD4Q96BZ4 506 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SERAC1Q96JX3 654 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC6A18Q96N87 628 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 IMPG2Q9BZV3 1241 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM245Q9H330 911 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 VRTNQ9H8Y1 702 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 USP29Q9HBJ7 922 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CPNE5Q9HCH3 593 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM131Q92545 1883 aa8.23□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PQH9 124 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 K7ENP7 123 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 USP12O75317 370 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 MOCS3O95396 460 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ASLP04424 464 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 GP1BAP07359 652 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 NNMTP40261 264 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 AMPD3Q01432 767 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ST3GAL1Q11201 340 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 NFATC3Q12968 1075 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST9Q7L1S5 443 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 BRAPQ7Z569 592 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ACOT1Q86TX2 421 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 FUKQ8N0W3 1084 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL14Q8N4G2 192 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 RDH13Q8NBN7 331 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC9Q92623 222 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF4BQ92750 862 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 WBP2Q969T9 261 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 HIC2Q96JB3 615 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 SMOQ99835 787 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 PRSS16Q9NQE7 514 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 GGA2Q9UJY4 613 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 DMTF1Q9Y222 760 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CKAP5Q14008 2032 aa8.22□□□□□ -1.09
PGGT1B-201ENST00000296642 CYSRT1A8MQ03 144 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CBX4O00257 560 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP26A1O43174 497 aa8.21□□□□□ -1.1
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF20AO95235 890 aa8.21□□□□□ -1.1
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