RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264723.8

CSPG5-201, Transcript of chondroitin sulfate proteoglycan 5, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSPG5, Length 4,080 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG5-201ENST00000264723 BIRC2Q13490 618 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CMC1Q7Z7K0 106 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 GSC2O15499 205 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 GOT1P17174 413 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PAMP19021 973 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SLC1A6P48664 564 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 MGAT5Q09328 741 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ZNF235Q14590 738 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ACAD11Q709F0 780 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PIGZQ86VD9 579 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SENP8Q96LD8 212 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CCDC134Q9H6E4 229 aa20.38■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ALADP13716 330 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 RABGGTBP53611 331 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CA9Q16790 459 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ICA1LQ8NDH6 482 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SLCO2A1Q92959 643 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CLUHO75153 1309 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SMAPO00193 183 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 RNF103O00237 685 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 BDNFP23560 247 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 HOXD10P28358 340 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PTP4A2Q12974 167 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 RINLQ6ZS11 566 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TMPRSS6Q8IU80 811 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TPP1O14773 563 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 GPR182O15218 404 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ICAM3P32942 547 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 FCGRTP55899 365 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ARHGEF6Q15052 776 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 C10orf120Q5SQS8 335 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ZNF410Q86VK4 478 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PLD5Q8N7P1 536 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 HTR3CQ8WXA8 447 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 NUF2Q9BZD4 464 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.37■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PPM1JQ5JR12 505 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PMF1Q6P1K2 205 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 DOCK2Q92608 1830 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ZBBXA8MT70 800 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CPA3P15088 417 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 MAP7Q14244 749 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 KLC3Q6P597 504 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SLC35B2Q8TB61 432 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ZNF570Q96NI8 536 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 Q9H521 79 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SAR1AQ9NR31 198 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TREHO43280 583 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PSMB4P28070 264 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SPRP35270 261 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 USP4Q13107 963 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ADGRD1Q6QNK2 874 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 C10orf82Q8WW14 230 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SERPINI1Q99574 410 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ZBED2Q9BTP6 218 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 IL1RL2Q9HB29 575 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PPME1Q9Y570 386 aa20.36■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 ODC1P11926 461 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 UNC5AQ6ZN44 842 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 MARK4Q96L34 752 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 NRCAMQ92823 1304 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 MSCO60682 206 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 IRF1P10914 325 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CNGA3Q16281 694 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 CHSY1Q86X52 802 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 SPATA6LQ8N4H0 392 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TAS2R1Q9NYW7 299 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 PMM2O15305 246 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 KLHL2O95198 593 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 OASLQ15646 514 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa20.35■□□□□ 0.85
CSPG5-201ENST00000264723 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms