RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 KIF5CO60282 957 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 C1RP00736 705 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 GOT1P17174 413 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ADRA1BP35368 520 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CXCR3P49682 368 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TUBP50607 506 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DYNLT1P63172 113 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MESP2Q0VG99 397 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HS1BP3Q53T59 392 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MS4A13Q5J8X5 152 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RTL10Q7L3V2 364 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SLFN11Q7Z7L1 901 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SMARCD2Q92925 531 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TLR10Q9BXR5 811 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 COMMD8Q9NX08 183 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 OR12D3Q9UGF7 316 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CLEC4EQ9ULY5 219 aa11.25□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KCNU1A8MYU2 1149 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CNTN5O94779 1100 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ARSAP15289 507 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PPP3CCP48454 512 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HARS2P49590 506 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ARCQ7LC44 396 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 STRADAQ7RTN6 431 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NAT16Q8N8M0 369 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CD101Q93033 1021 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 IGSF8Q969P0 613 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HAUS1Q96CS2 278 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MS4A14Q96JA4 679 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ETNK2Q9NVF9 386 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 STIM2Q9P246 746 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 BPTFQ12830 3046 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NARSO43776 548 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 LRIG2O94898 1065 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 IGLV3-27P01718 113 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PYGMP11217 842 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MTHFRP42898 656 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SOX9P48436 509 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CDH6P55285 790 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SLC7A9P82251 487 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 COG7P83436 770 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 AAK1Q2M2I8 961 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ALFQ53S48 1182 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 C11orf63Q6NUN7 778 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KLHDC10Q6PID8 442 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TMEM25Q86YD3 366 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NIPA2Q8N8Q9 360 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 LEMD2Q8NC56 503 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ERLEC1Q96DZ1 483 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZFP14Q9HCL3 533 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 FZD10Q9ULW2 581 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DENND4AQ7Z401 1863 aa11.24□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ESPNB1AK53 854 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KCNK3O14649 394 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ENDOD1O94919 500 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PAPLNO95428 1278 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 APOEP02649 317 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 GBP1P32455 592 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HADHBP55084 474 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZNF77Q15935 545 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ERMARDQ5T6L9 678 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 FBXL22Q6P050 247 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MFSD7Q6UXD7 560 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 CHSY1Q86X52 802 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SFTPA1Q8IWL2 248 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 TRIM58Q8NG06 486 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 OR52K2Q8NGK3 314 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 WFDC5Q8TCV5 224 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 COG1Q8WTW3 980 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KCNK12Q9HB15 430 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 AMFRQ9UKV5 643 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 HELZP42694 1942 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KRT1P04264 644 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 ARTNQ5T4W7 220 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 MEI1Q5TIA1 1274 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 LGI2Q8N0V4 545 aa11.23□□□□□ -0.61
TTPA-201ENST00000260116 KCTD6Q8NC69 237 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms