RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255476.2

RFXAP-201, Transcript of regulatory factor X associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RFXAP, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa21.84■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 RIPK2O43353 540 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 ACSL3O95573 720 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 SRGAP2BP0DMP2 458 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 MTM1Q13496 603 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 MORF4L2Q15014 288 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 KCTD16Q68DU8 428 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 CCDC110Q8TBZ0 833 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 SPATA17Q96L03 361 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 SPG21Q9NZD8 308 aa21.83■■□□□ 1.09
RFXAP-201ENST00000255476 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 LAG3P18627 525 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 GLUD2P49448 558 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 DSG1Q02413 1049 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 EFEMP1Q12805 493 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 KYNUQ16719 465 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 DENND2CQ68D51 928 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 LRIG3Q6UXM1 1119 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 EXOC4Q96A65 974 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PAGE1O75459 146 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 BAIAP3O94812 1187 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 VAV1P15498 845 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 EPHB2P29323 1055 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CCR1P32246 355 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 XRCC4Q13426 336 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SPDYCQ5MJ68 293 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 FAXCQ5TGI0 409 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 NPWQ8N729 165 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 C9orf72Q96LT7 481 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CENPHQ9H3R5 247 aa21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 BANF1O75531 89 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 TMEM63AO94886 807 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PPIL6Q8IXY8 311 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 VPS52Q8N1B4 723 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 NAT8LQ8N9F0 302 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 RTP4Q96DX8 246 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 EPAS1Q99814 870 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SHROOM3Q8TF72 1996 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 IFFO1Q0D2I5 559 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 MIB1Q86YT6 1006 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SH2D3CQ8N5H7 860 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SERPINB11Q96P15 392 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SHOC2Q9UQ13 582 aa21.81■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CFAP69A5D8W1 941 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 ACTN2P35609 894 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 HCAR3P49019 387 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 BRMS1LQ5PSV4 323 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 ZNF461Q8TAF7 563 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PRDM12Q9H4Q4 367 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SAYSD1Q9NPB0 183 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 NINJ2Q9NZG7 142 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 FGBP02675 491 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 NUDT17P0C025 328 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 AP1B1Q10567 949 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CCNYQ8ND76 341 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CEP41Q9BYV8 373 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 OSBPL2Q9H1P3 480 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 ABLIM3O94929 683 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PPP2R5DQ14738 602 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 SKIDA1Q1XH10 827 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PCGF5Q86SE9 256 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 PAK5Q9P286 719 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 NEU3Q9UQ49 428 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 KCNU1A8MYU2 1149 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 GJB5O95377 273 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 TTC4O95801 387 aa21.79■■□□□ 1.08
RFXAP-201ENST00000255476 URODP06132 367 aa21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms