RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064190.12

Rai1-201, Transcript of Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rai1, Length 7,348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ntrk1Q3UFB7 799 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rnf139Q7TMV1 668 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fam126bQ8C729 530 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 RhoaQ9QUI0 193 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 PaicsQ9DCL9 425 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sgpp1Q9JI99 430 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 DiabloQ9JIQ3 237 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nrf1Q9WU00 503 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gja1P23242 382 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nos2P29477 1144 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc29a2Q61672 456 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ccdc28bQ8CEG5 200 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Map3k15A2AQW0 1331 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pgbd1E9Q492 415 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ccnb1P24860 430 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Trappc3lQ4KL14 181 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pla2g4eQ50L42 875 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nlrp9bQ66X22 1003 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Prdm8Q8BZ97 687 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Kbtbd4Q8R179 534 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Taf6lQ8R2K4 616 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 RpainQ9CWY9 219 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ddit4Q9D3F7 229 aa16.38■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cyp2b23E9Q593 491 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Scamp3O35609 349 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Il1rnP25085 178 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cyp2f2P33267 491 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ndufs6P52503 116 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rpl10aP53026 217 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 9230104L09RikQ9D264 133 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Stk4Q9JI11 487 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Uggt2E9Q4X2 1504 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hes2O54792 157 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmprss11aQ3UQ41 389 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Klra3Q64329 266 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Teddm1bQ8CC62 306 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Adcy4Q91WF3 1077 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pramel1Q99MW3 458 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm45233A0A0N4SVE0 221 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nfkb1P25799 971 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Serpina3cP29621 417 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Prox1P48437 737 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rbm44Q3V089 1013 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmem237Q3V0J1 427 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gcnt3Q5JCT0 437 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Castor2Q8CAB8 329 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Kct2Q8K201 259 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tspan8Q8R3G9 235 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pbdc1Q9D0B6 198 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Med8Q9D7W5 268 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Chil5A0A0G2JDS2 431 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm17175E9Q528 179 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Edrf1Q6GQV7 1239 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Yipf1Q91VU1 306 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Smim11aQ99J19 55 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ate1Q9Z2A5 516 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mbd2Q9Z2E1 414 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Usp19Q3UJD6 1360 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc6a16A0A1L1SR47 742 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rab17P35292 214 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tgoln2Q62314 363 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Med24Q99K74 987 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pin4Q9CWW6 131 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Armt1A6H630 439 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mks1Q5SW45 561 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Alg1Q921Q3 482 aa16.37■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Atp8b4A2ANX3 1194 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 EloblA6PWE0 161 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Kdm7aQ3UWM4 940 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Colgalt2Q6NVG7 625 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ddhd1Q80YA3 547 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fbxl4Q8BH70 621 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Use1Q9CQ56 270 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Atp13a4Q5XF90 1193 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 E2f5Q61502 335 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ess2O70279 479 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Defa17Q64016 82 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pcdh19Q80TF3 1145 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Plin5Q8BVZ1 463 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Bmp15Q9Z0L4 392 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zfp712E9PXJ4 705 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Lgals7O54974 136 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ptchd3Q0EEE2 906 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Serpina3gQ5I2A0 440 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nuak2Q8BZN4 639 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zbtb6Q8K088 423 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ace2Q8R0I0 805 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mageb16Q9CWV4 363 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cyb561d2Q9WUE3 222 aa16.36■□□□□ 0.21
Rai1-201ENSMUST00000064190 MndalD0QMC3 538 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.1 ms