RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000042312.13

Trafd1-201, Transcript of TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trafd1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmbim4Q9DA39 238 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ddx21Q9JIK5 851 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Thsd7bQ6P4U0 1607 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cbfa2t2O70374 594 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Emilin3P59900 758 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyth2P63034 400 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sparcl1P70663 650 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmprss15P97435 1069 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zdhhc17Q80TN5 632 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Armc12Q80X86 340 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem260Q8BMD6 703 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sytl1Q99N80 567 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arhgap8Q9CXP4 425 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 St6galnac4Q9R2B6 360 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Nme3Q9WV85 169 aa22.7■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Gm379J3QQ19 296 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dnmt3cP0DOY1 709 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfy2P20662 777 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CblP22682 913 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Scg3P47867 471 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Kcnj6P48542 425 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cage1Q5IR70 849 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc5a10Q5SWY8 596 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 PigaQ64323 485 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Senp5Q6NXL6 749 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Robo4Q8C310 1012 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Clip4Q8CI96 704 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CitP49025 2055 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Trdmt1O55055 415 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc12a1P55014 1095 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Morf4l1P60762 362 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arl4aP61213 200 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ripply1Q2WG77 201 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 ProcrQ64695 242 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Naif1Q6PFD7 327 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Bnip1Q6QD59 228 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr389Q7TRX7 312 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Syne4Q8CII8 388 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Q8CIL4 281 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dedd2Q8QZV0 330 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc80Q8R2G6 949 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wbp11Q923D5 641 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tpgs1Q99MS8 303 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MrgbpQ9DAT2 204 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rassf7Q9DD19 359 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rgs17Q9QZB0 210 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa22.69■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp850J3QPC5 689 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 BpgmP15327 259 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 KizQ3UXL4 695 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Znf512Q69Z99 562 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 DgkqQ6P5E8 934 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Abhd10Q6PE15 297 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pwp2Q8BU03 919 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wdr60Q8C761 999 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Evi2bQ8VD58 444 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 MyocdQ8VIM5 935 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Pcdha1Q91Y21 948 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Prmt7Q922X9 692 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Homer3Q99JP6 356 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CabyrQ9D424 453 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dcaf6Q9DC22 876 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Dlc1Q9R0Z9 1092 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Daw1D3Z7A5 415 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr600E9PUN7 314 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Sptlc1O35704 473 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cd2P08920 344 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Wnt3aP27467 352 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 B3gntl1Q3U129 357 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mpzl3Q3V3F6 237 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Zfp658Q5PPQ4 887 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Slc26a2Q62273 739 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arl5cQ6P068 179 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Arrdc3Q7TPQ9 414 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Usp6nlQ80XC3 819 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ace2Q8R0I0 805 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Agap3Q8VHH5 910 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Tmem115Q9WUH1 350 aa22.68■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 2310061I04RikB8JJ69 315 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfr1354E9Q5G9 310 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fbxw2Q60584 422 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Map3k7Q62073 579 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Lrrc27Q80YS5 523 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ccdc63Q8CDV6 558 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 4930513O06RikQ9D549 161 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Rsph3bQ9DA80 389 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Krt90E9Q1Z0 538 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Fam71e2L7N480 754 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Cyp2j6O54750 501 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 NcstnP57716 708 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Olfm3P63056 478 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 RnaselQ05921 735 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 Samd11Q1RNF8 542 aa22.67■■□□□ 1.22
Trafd1-201ENSMUST00000042312 CybbQ61093 570 aa22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.6 ms