RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1057Q7TR75 315 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Thap3Q8BJ25 218 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sfr1Q8BP27 319 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scara3Q8C850 606 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Akr1c20Q8VC77 323 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vangl2Q91ZD4 521 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MtrexQ9CZU3 1040 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc40a1Q9JHI9 570 aa11.23□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PtenO08586 403 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 KlO35082 1014 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spink5Q148R4 1017 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vps51Q3UVL4 782 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adcy2Q80TL1 1090 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pgrmc2Q80UU9 217 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dmtf1Q8CE22 761 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 WwoxQ91WL8 414 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tfap2dQ91ZK0 452 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cog2Q921L5 731 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdk3Q922H2 415 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ralgps2Q9ERD6 590 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pole3Q9JKP7 145 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tns2Q8CGB6 1400 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fgf10O35565 209 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Stra6O70491 670 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf821Q6PD05 413 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PdgfrlQ6PE55 375 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Morc4Q8BMD7 928 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PolbQ8K409 335 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SarafQ8R3Q0 334 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kif13aQ9EQW7 1749 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r74E9PW21 853 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc10a3P21129 473 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pola2P33611 600 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Btg3P50615 252 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GsapQ3TCV3 858 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gxylt1Q3UHH8 404 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lsg1Q3UM18 644 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scn2bQ56A07 215 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Egfl8Q6GUQ1 293 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Dis3lQ8C0S1 1053 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8CEZ4 452 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acot13Q9CQR4 140 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mfsd10Q9D2V8 456 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wnt8bQ9WUD6 350 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lgr5Q9Z1P4 907 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt1a8D3Z748 530 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt1a10E9PXN7 530 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prl2c3P04768 224 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Smpdl3bP58242 456 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Emilin3P59900 758 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt1a2P70691 533 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Plpp4Q0VBU9 271 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Xlr3aQ60595 226 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Grik1Q60934 836 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt1a9Q62452 528 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ugt1a1Q63886 535 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tpp2Q64514 1262 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vipas39Q8BGQ1 491 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Strip2Q8C9H6 844 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdc16Q8R349 620 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lrrc14Q8VC16 493 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syt12Q920N7 421 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nkd1Q99MH6 471 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gemin2Q9CQQ4 269 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rhobtb1Q9DAK3 695 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ruvbl2Q9WTM5 463 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AlpiF8VPQ6 554 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hsd17b7O88736 334 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gtf2bP62915 316 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CiitaP79621 1155 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rcsd1Q3UZA1 412 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Scube3Q66PY1 993 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpc2Q8BKV1 579 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prdm8Q8BZ97 687 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam118bQ8C569 351 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mettl13Q91YR5 698 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ecrg4Q99LS0 148 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PignQ9R1S3 931 aa11.22□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klra1P20937 262 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tbc1d1Q60949 1255 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q6PAC4 1279 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gja6Q6S5G4 283 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 E2f7Q6S7F2 904 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ntrk3Q6VNS1 825 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AopepQ8BXQ6 817 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem82Q8R115 356 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Exo5Q9CXP9 373 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hspa12bQ9CZJ2 685 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pgm1Q9D0F9 562 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pdcd7Q9WTY1 482 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gbp11A9YVJ5 442 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ncam2O35136 837 aa11.21□□□□□ -0.61
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MylpfP97457 169 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.6 ms