RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 TULP2O00295 520 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CETN3O15182 167 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM44O43615 452 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 IGLV3-19P01714 112 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 EPB41P11171 864 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 COPAP53621 1224 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 SORCS1Q8WY21 1168 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CIPCQ9C0C6 399 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 PRKCHP24723 683 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 PDE4CQ08493 712 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CBWD6Q4V339 395 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CBWD3Q5JTY5 395 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CBWD5Q5RIA9 395 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN16Q9UKR8 245 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 COQ4Q9Y3A0 265 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 LAMA5O15230 3695 aa26.06■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CKAP5Q14008 2032 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 METTL12A8MUP2 240 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 BCAT1P54687 386 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 MPPE1Q53F39 396 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF12L1Q5VU92 463 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 NAXDQ8IW45 347 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 NUP58Q9BVL2 599 aa26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 EPHX1P07099 455 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ACADMP11310 421 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 HARS2P49590 506 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CUL2Q13617 745 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 SGO2Q562F6 1265 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 LRRC4Q9HBW1 653 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 STOML2Q9UJZ1 356 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa26.04■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ADIGQ0VDE8 80 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 BST2Q10589 180 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 TCERG1LQ5VWI1 586 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 RNF139Q8WU17 664 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 HESX1Q9UBX0 185 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ATRXP46100 2492 aa26.03■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 E7ENQ6 273 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN3O60637 253 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 HLA-FP30511 346 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 PRCPP42785 496 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF445P59923 1031 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ARID5AQ03989 594 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 CACUL1Q86Y37 369 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 OR2T3Q8NH03 318 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 EDEM1Q92611 657 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 KNL1Q8NG31 2342 aa26.02■■□□□ 1.76
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CBFA2T3O75081 653 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 FTH1P19P0C7X4 201 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 C7P10643 843 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 HLA-EP13747 358 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ADGRF1Q5T601 910 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf216Q8TAB5 229 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 UBA3Q8TBC4 463 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC34Q96HJ3 373 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PCED1AQ9H1Q7 454 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM245Q9H330 911 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 IL21RQ9HBE5 538 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 LATS1O95835 1130 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CAPNS1P04632 268 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF883P0CG24 379 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 VDRP11473 427 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 CD19P15391 556 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 BNC1Q01954 994 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 PNOCQ13519 176 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 COBLL1Q53SF7 1204 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 SCML4Q8N228 414 aa26■■□□□ 1.75
PTPRF-216ENST00000617451 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa26■■□□□ 1.75
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