RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 FTHL17Q9BXU8 183 aa20.7■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 SLC22A9Q8IVM8 553 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 VCPIP1Q96JH7 1222 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 MIEF1Q9NQG6 463 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 VPS51Q9UID3 782 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 GAKO14976 1311 aa20.69■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 MPP6Q9NZW5 540 aa20.69■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D3BA6NDS4 549 aa20.69■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa20.69■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 DUSP10Q9Y6W6 482 aa20.69■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 AMPD1P23109 780 aa20.68■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 DISP2A7MBM2 1401 aa20.68■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 PWP1Q13610 501 aa20.68■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.68■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 NME5P56597 212 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 FBXL19Q6PCT2 694 aa20.68■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ULBP1Q9BZM6 244 aa20.68■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 RARGP13631 454 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 TPH1P17752 444 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 UBE3AQ05086 875 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
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CTDP1-208ENST00000613122 IFNA14P01570 189 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 MPOP05164 745 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 THRAP10827 490 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 PRLRP16471 622 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 SLC12A3P55017 1021 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM69Q86WT6 500 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 HMGCRP04035 888 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa20.67■□□□□ 0.9
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
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