RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605833.1

VIM-AS1-202, VIM antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VIM-AS1, Length 918 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIM-AS1-202ENST00000605833 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYBBP04839 570 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACADMP11310 421 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CMA1P23946 247 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 PIGZQ86VD9 579 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF366Q8N895 744 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCDC150Q8NCX0 1101 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 SEMA4DQ92854 862 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 STRIP2Q9ULQ0 834 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 FASNP49327 2511 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
VIM-AS1-202ENST00000605833 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1W2PQ27 194 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1W2PQ64 194 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 CER1O95813 267 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 OXTRP30559 389 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 MATKP42679 507 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF132P52740 706 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 MDM1Q8TC05 714 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TM7SF3Q9NS93 570 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 CISHQ9NSE2 258 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 GPSM3Q9Y4H4 160 aa21.82■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 A0A1B0GVT2 93 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TULP2O00295 520 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TSPAN3O60637 253 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 IGLV3-19P01714 112 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TKTL1P51854 596 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 RAD23BP54727 409 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARID5AQ03989 594 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACAP1Q15027 740 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 HLA-BQ31612 363 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 CPXM2Q8N436 756 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TMEM176AQ96HP8 235 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 NUP58Q9BVL2 599 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.81■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 NFIL3Q16649 462 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 RAB41Q5JT25 222 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 KRT39Q6A163 491 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 GLRX5Q86SX6 157 aa21.8■■□□□ 1.08
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VIM-AS1-202ENST00000605833 FAM217AQ8IXS0 508 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 C1orf216Q8TAB5 229 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLD4Q96BZ4 506 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 EEF2KMTQ96G04 330 aa21.8■■□□□ 1.08
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VIM-AS1-202ENST00000605833 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 HPSEQ9Y251 543 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 APC2O95996 2303 aa21.8■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 RHOBTB3O94955 611 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 MYL1P05976 194 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACSL1P33121 698 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 MXI1P50539 228 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ARHGAP17Q68EM7 881 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 LAYNQ6UX15 382 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 OR2T3Q8NH03 318 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 SLC2A11Q9BYW1 496 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 LHX5Q9H2C1 402 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 USP25Q9UHP3 1055 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 KNL1Q8NG31 2342 aa21.79■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ACACAQ13085 2346 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZBED1O96006 694 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ZNF883P0CG24 379 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 HLA-FP30511 346 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 ADAM9Q13443 819 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 COL28A1Q2UY09 1125 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 IL27RAQ6UWB1 636 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 EDEM1Q92611 657 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 TATDN2Q93075 761 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa21.78■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 IGSF10Q6WRI0 2623 aa21.77■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 PLXNA2O75051 1894 aa21.77■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.77■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 MSI1O43347 362 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 SYKP43405 635 aa21.77■■□□□ 1.08
VIM-AS1-202ENST00000605833 SGSHP51688 502 aa21.77■■□□□ 1.08
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