RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ATL3	Q6DD88	541 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GLRX5	Q86SX6	157 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF366	Q8N895	744 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MDM1	Q8TC05	714 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX21	Q969T3	373 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DCLK3	Q9C098	648 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GAREM1	Q9H706	876 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CISH	Q9NSE2	258 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GVT2	93 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF883	P0CG24	379 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CMA1	P23946	247 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-F	P30511	346 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SGSH	P51688	502 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TKTL1	P51854	596 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DPYD	Q12882	1025 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	HLA-B	Q31612	363 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	LAYN	Q6UX15	382 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DDI1	Q8WTU0	396 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	UCMA	Q8WVF2	138 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PLD4	Q96BZ4	506 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP45	Q9UL16	551 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN3	O60637	253 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DKK1	O94907	266 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CER1	O95813	267 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CYBB	P04839	570 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MYL1	P05976	194 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT13	P13646	458 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	OXTR	P30559	389 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ACSL1	P33121	698 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MATK	P42679	507 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MXI1	P50539	228 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFA8	P51970	172 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ENPEP	Q07075	957 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAP1	Q15027	740 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PTPRN	Q16849	979 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT39	Q6A163	491 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2T3	Q8NH03	318 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	WFDC5	Q8TCV5	224 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SNX19	Q92543	992 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TATDN2	Q93075	761 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	NUP58	Q9BVL2	599 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM245	Q9H330	911 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	USP25	Q9UHP3	1055 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	BPTF	Q12830	3046 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ZBED1	O96006	694 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	C7	P10643	843 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ACADM	P11310	421 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SYK	P43405	635 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE4C	Q08493	712 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ADIG	Q0VDE8	80 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAM9	Q13443	819 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF19	Q2TAC6	998 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TTLL3-233	ENST00000602338	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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