RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	DIP2A	Q14689	1571 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MSH6	P52701	1360 aa		4.01	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	NLRP1	Q9C000	1473 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084		E5RJQ4	531 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FYB1	O15117	783 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FGF18	O76093	207 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	NDST3	O95803	873 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MYL4	P12829	197 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TNFSF4	P23510	183 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	THBS4	P35443	961 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ARHGAP25	P42331	645 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PRELP	P51888	382 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC14A1	Q13336	389 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PMS2P11	Q13670	270 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	C4orf46	Q504U0	113 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	DENND2C	Q68D51	928 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GGT6	Q6P531	493 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MAP4K1	Q92918	833 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MAGEB5	Q9BZ81	275 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TIAM1	Q13009	1591 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RASA4B	C9J798	803 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TMEM232	C9JQI7	657 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RASA4	O43374	803 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	LMO1	P25800	156 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GALNS	P34059	522 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	NEK3	P51956	506 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ATP1A4	Q13733	1029 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	KCNB1	Q14721	858 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ETFDH	Q16134	617 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FAXC	Q5TGI0	409 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	IL31	Q6EBC2	164 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	DPP9	Q86TI2	863 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	USP29	Q9HBJ7	922 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CHST12	Q9NRB3	414 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RGL1	Q9NZL6	768 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		3.99	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PZP	P20742	1482 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	PLXNC1	O60486	1568 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ATRN	O75882	1429 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084		M0QZQ0	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RRH	O14718	337 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	COQ9	O75208	318 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	MOSPD3	O75425	235 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	EGR1	P18146	543 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RHBDL3	P58872	404 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	CFHR1	Q03591	330 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GPS1	Q13098	491 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	GAB1	Q13480	694 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	LONRF1	Q17RB8	773 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		3.98	□□□□□ -1.77
COX11-208	ENST00000576084		Q4G0T1	1027 aa		3.98	□□□□□ -1.77

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