RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561431.1

LRRC28-222, Transcript of leucine rich repeat containing 28, human

TSL 3

Gene LRRC28, Length 754 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRRC28-222	ENST00000561431	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SYT17	Q9BSW7	474 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PODXL	O00592	558 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	AREL1	O15033	823 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CCP110	O43303	1012 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LPXN	O60711	386 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SPDEF	O95238	335 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TYRP1	P17643	537 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	GATA3	P23771	443 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PSMA3	P25788	255 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	BMPR1A	P36894	532 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TSPAN7	P41732	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	HAL	P42357	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DGCR2	P98153	550 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC25A3	Q00325	362 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	FOXE3	Q13461	319 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	TP53BP2	Q13625	1128 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PTPA	Q15257	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	MIIP	Q5JXC2	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	VPS53	Q5VIR6	699 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ANO1	Q5XXA6	986 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	LCORL	Q8N3X6	602 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431		Q8NA96	180 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	FZD1	Q9UP38	647 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LRRC28-222	ENST00000561431	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	FFAR2	O15552	330 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNQ3	O43525	872 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	SNX2	O60749	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	COQ9	O75208	318 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZFPL1	O95159	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NDST3	O95803	873 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	GYS1	P13807	737 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DGKE	P52429	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ICA1	Q05084	483 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DCTN1	Q14203	1278 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ZNF790	Q6PG37	636 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	MCM10	Q7L590	875 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LRRC28-222	ENST00000561431	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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