RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	RRAGA	Q7L523	313 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	C3orf49	Q96BT1	292 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF778	Q96MU6	729 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	MGAT4C	Q9UBM8	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	NFU1	Q9UMS0	254 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	DAPP1	Q9UN19	280 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	KIF28P	B7ZC32	967 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PRRT4	C9JH25	899 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876		H7C1Q1	480 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	MPG	P29372	298 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	MCM5	P33992	734 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PRKAA2	P54646	552 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TUBA4A	P68366	448 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CUL4B	Q13620	913 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TAF12	Q16514	161 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FBXO47	Q5MNV8	452 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	OR6Y1	Q8NGX8	325 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	AFG1L	Q8WV93	481 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	HMGB4	Q8WW32	186 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	THAP4	Q8WY91	577 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CPT1B	Q92523	772 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	C1QTNF7	Q9BXJ2	289 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	VPS16	Q9H269	839 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	RNF7	Q9UBF6	113 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	AMFR	Q9UKV5	643 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	WDR91	A4D1P6	747 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876		B9A039	149 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876		H0Y3Z8	333 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CA12	O43570	354 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TMPRSS11D	O60235	418 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	EXOC3	O60645	756 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PRR35	P0CG20	571 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CDK4	P11802	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	TTC22	Q5TAA0	569 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RBM23-208	ENST00000553876	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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