RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 ERCC2P18074 760 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TLE2Q04725 743 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EFHC2Q5JST6 749 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RTP2Q5QGT7 225 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LEKR1Q6ZMV7 388 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CASP10Q92851 521 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 WDCPQ9H6R7 721 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ADAM28Q9UKQ2 775 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ELK3P41970 407 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CRADDP78560 199 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RFX8Q6ZV50 586 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CENPUQ71F23 418 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SCD5Q86SK9 330 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 A0A1W2PQH9 124 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FBXO21O94952 628 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 STIP1P31948 543 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FAAP100Q0VG06 881 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MPP2Q14168 576 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 C6orf118Q5T5N4 469 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PGM2Q96G03 612 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 UROC1Q96N76 676 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 DSEQ9UL01 958 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 E7EVH7 732 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TNFRSF10BO14763 440 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ADAM12O43184 909 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FAM163BP0C2L3 166 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 BFSP2Q13515 415 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 KCNJ11Q14654 390 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SLC45A4Q5BKX6 768 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 MPP5Q8N3R9 675 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SERPINB12Q96P63 405 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 OR12D3Q9UGF7 316 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ALOX15BO15296 676 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LRIG2O94898 1065 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CCT5P48643 541 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TPI1P60174 286 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SPARCL1Q14515 664 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PM20D1Q6GTS8 502 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FAM129AQ9BZQ8 928 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SPAG7O75391 227 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CSPG5O95196 566 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CPB1P15086 417 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EPHB2P29323 1055 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 ARL4CP56559 192 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 CFAP36Q96G28 342 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 P2RY11Q96G91 374 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 NDFIP2Q9NV92 336 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 INPPL1O15357 1258 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 ALDH2P05091 517 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 TYMPP19971 482 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 DPYSQ14117 519 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 FBF1Q8TES7 1133 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 HTR3CQ8WXA8 447 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 SEPT8Q92599 483 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 AGAP3Q96P47 875 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 OLFM3Q96PB7 478 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 DCLK1O15075 740 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 USP12O75317 370 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 OAZ2O95190 189 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 C4orf33Q8N1A6 199 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 GIPC2Q8TF65 315 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 A0A1W2PPM1 405 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 H3BRJ5 948 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 FAM155BO75949 473 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTN1-205ENST00000538545 GALTP07902 379 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms