RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517100.1

RNU6-201P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 201, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-201P, Length 61 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-201P-201ENST00000517100 GRK6P43250 576 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRKAA2P54646 552 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RPL15P61313 204 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TUBA4AP68366 448 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RANBP10Q6VN20 620 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF66Q6ZN08 573 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 EXOC8Q8IYI6 725 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RUBCNQ92622 972 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 C3orf49Q96BT1 292 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 C5orf34Q96MH7 638 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ASB2Q96Q27 587 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PAGR1Q9BTK6 254 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 MYLK2Q9H1R3 596 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CDCP1Q9H5V8 836 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 GXYLT2A0PJZ3 443 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 WIPF3A6NGB9 483 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 AGAP5A6NIR3 686 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 UBE2Q2LH0YL09 131 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 KRT38O76015 456 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CYP21A2P08686 494 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 DUSP1P28562 367 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 FOXO1Q12778 655 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CUL4BQ13620 913 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRKG1Q13976 671 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RPS6KA2Q15349 733 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CNGA3Q16281 694 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 GALNTL6Q49A17 601 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CEP78Q5JTW2 689 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TANGO2Q6ICL3 276 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRIMA1Q86XR5 153 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 GALNT15Q8N3T1 639 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 HASPINQ8TF76 798 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 GPR78Q96P69 363 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CRAMP1Q96RY5 1269 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 HERPUD2Q9BSE4 406 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 FAM167BQ9BTA0 163 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 NUAK2Q9H093 628 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 MLXIPLQ9NP71 852 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SEMA5BQ9P283 1151 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 LZTS1Q9Y250 596 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa4.06□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 LINC01548A6NM66 108 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 B9A039 149 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 BTBD19C9JJ37 291 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TMEM232C9JQI7 657 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 H0Y3Z8 333 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 RRHO14718 337 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 NKX2-8O15522 239 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PRKCGP05129 697 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 NDUFS1P28331 727 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 IDUAP35475 653 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 PDCLQ13371 301 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CBFBQ13951 182 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 TRIM60Q495X7 471 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 LRRC24Q50LG9 513 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 NFRKBQ6P4R8 1299 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 VSTM1Q6UX27 236 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SYT13Q7L8C5 426 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 SMC5Q8IY18 1101 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 GLMPQ8WWB7 406 aa4.05□□□□□ -1.76
RNU6-201P-201ENST00000517100 FAR2Q96K12 515 aa4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms