RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516073.1

RNU6-475P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 475, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-475P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-475P-201ENST00000516073 ISM1B1AKI9 464 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KIR2DS3K7RE56 304 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PODXLO00592 558 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FRS3O43559 492 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KRT86O43790 486 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 IL18RAPO95256 599 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PLGP00747 810 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 MT-ND5P03915 603 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ATICP31939 592 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 HOXD12P35452 270 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KEAP1Q14145 624 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KCNJ12Q14500 433 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KRT81Q14533 505 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DGKKQ5KSL6 1271 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DDIASQ8IXT1 998 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 BCAS4Q8TDM0 211 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KAT2AQ92830 837 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SNX22Q96L94 193 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 GPR78Q96P69 363 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 WDR24Q96S15 920 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ZNF287Q9HBT7 754 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ZNF212Q9UDV6 495 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 OGDHLQ9ULD0 1010 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 EVPLQ92817 2033 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 A0A1B0GVT2 93 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 BECN2A8MW95 431 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DDNO94850 711 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 CAMTA2O94983 1202 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KAT7O95251 611 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 IGKV3-20P01619 116 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PEPDP12955 493 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 MYF5P13349 255 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DMWDQ09019 674 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 TRAF1Q13077 416 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 GALEQ14376 348 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 RNF220Q5VTB9 566 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FAM90A2PQ658T7 463 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 CRTC1Q6UUV9 634 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 C16orf89Q6UX73 402 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KRT28Q7Z3Y7 464 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 TMEM174Q8WUU8 243 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 LRTOMTQ8WZ04 291 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ZDHHC12Q96GR4 267 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 APIPQ96GX9 242 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FAM227BQ96M60 508 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 MEIS3Q99687 375 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SENP7Q9BQF6 1050 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ELOVL1Q9BW60 279 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 APOL5Q9BWW9 433 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 MAP6D1Q9H9H5 199 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SPAG4Q9NPE6 437 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 CAPN11Q9UMQ6 739 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 INAFM1C9JVW0 142 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SPTLC2O15270 562 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 RFPL1O75677 317 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PDGFRBP09619 1106 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 RFPL3SP0C7P2 107 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KRT10P13645 584 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DUSP1P28562 367 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ENTPD1P49961 510 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 RRP1P56182 461 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DSCR9P59020 149 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 DLGAP5Q15398 846 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FAM76BQ5HYJ3 339 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 GFI1BQ5VTD9 330 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 LIPMQ5VYY2 423 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 NADSYN1Q6IA69 706 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 CCDC149Q6ZUS6 474 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 PRR26Q8N8Z3 221 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 NR4A3Q92570 626 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 ZNF347Q96SE7 839 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 MAGEH1Q9H213 219 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 CDCP1Q9H5V8 836 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 FZD3Q9NPG1 666 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-475P-201ENST00000516073 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms