RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515753.1

HERC4-215, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, human

TSL 2

Gene HERC4, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HERC4-215	ENST00000515753	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		3.76	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		3.76	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	FAM234B	A2RU67	622 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	RNF8	O76064	485 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	VIP	P01282	170 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	FGB	P02675	491 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	DUSP1	P28562	367 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	HSPA7	P48741	367 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	COPB1	P53618	953 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MIDN	Q504T8	468 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CCDC138	Q96M89	665 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MYD88	Q99836	296 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TAGLN3	Q9UI15	199 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		3.75	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PLA2G6	O60733	806 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	NDST3	O95803	873 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MYL3	P08590	195 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PRF1	P14222	555 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SCP2	P22307	547 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MMP8	P22894	467 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PBX1	P40424	430 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TTC3	P53804	2025 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CFHR1	Q03591	330 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	KRT72	Q14CN4	511 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	IL31	Q6EBC2	164 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ANO7	Q6IWH7	933 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	KIAA1161	Q6NSJ0	714 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	RANBP10	Q6VN20	620 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CERS4	Q9HA82	394 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	NES	P48681	1621 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CLIC1	O00299	241 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	DSCR3	O14972	297 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CA12	O43570	354 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	GALNS	P34059	522 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	NEK3	P51956	506 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	JAK3	P52333	1124 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	HSF1	Q00613	529 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SLC14A1	Q13336	389 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SEC23B	Q15437	767 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	RAB30	Q15771	203 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MORC1	Q86VD1	984 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SKAP1	Q86WV1	359 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	GLMP	Q8WWB7	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	MAP4K1	Q92918	833 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ZNF566	Q969W8	418 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	COQ8B	Q96D53	544 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	TNIP3	Q96KP6	325 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		3.73	□□□□□ -1.81
HERC4-215	ENST00000515753	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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