RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515575.1

RPS4Y1-204, Transcript of ribosomal protein S4 Y-linked 1, human

TSL 3

Gene RPS4Y1, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ATG9B	Q674R7	924 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMEM65	Q6PI78	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CUL5	Q93034	780 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MYD88	Q99836	296 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CERS4	Q9HA82	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ICK	Q9UPZ9	632 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575		B4DGG1	531 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KRT86	O43790	486 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MT3	P25713	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	THBS4	P35443	961 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KRT81	Q14533	505 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	KCNB1	Q14721	858 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MLXIPL	Q9NP71	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TMEM232	C9JQI7	657 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PODXL	O00592	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PCDH17	O14917	1159 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	PLA2G6	O60733	806 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DRD1	P21728	446 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GAB1	Q13480	694 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RAB30	Q15771	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	P3H2	Q8IVL5	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MAP4K1	Q92918	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GJA10	Q969M2	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	STK33	Q9BYT3	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RRH	O14718	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TLR2	O60603	784 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ALAD	P13716	330 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67	5e-7	■■■□□ 15.7
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	HS6ST2	Q96MM7	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CDC23	Q9UJX2	597 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	DGKQ	P52824	942 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	YPEL5	P62699	121 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	BFSP2	Q13515	415 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	RFX6	Q8HWS3	928 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
RPS4Y1-204	ENST00000515575	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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