RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TM9SF3Q9HD45 589 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 SIX4Q9UIU6 781 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CBX4O00257 560 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CLIC2O15247 247 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CALUO43852 315 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TMPRSS3P57727 454 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ORC1Q13415 861 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ARHGAP40Q5TG30 622 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 BROXQ5VW32 411 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 BHMTQ93088 406 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 HPDLQ96IR7 371 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ELOVL4Q9GZR5 314 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.38■□□□□ 0.212e-13■■■■■ 158.6
ZBED1-205ENST00000515319 MARK1Q9P0L2 795 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PTPRJQ12913 1337 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 NPC1O15118 1278 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 DFNA5O60443 496 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 EXOC3O60645 756 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CISD3P0C7P0 127 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TUBP50607 506 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CYP2J2P51589 502 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CDH8P55286 799 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TBC1D25Q3MII6 688 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PKDCCQ504Y2 493 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 HTR3DQ70Z44 454 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 LIMS2Q7Z4I7 341 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ERICH1Q86X53 443 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 GATAD2AQ86YP4 633 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 MMS19Q96T76 1030 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 SNX25Q9H3E2 840 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PPP1R2P41236 205 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CTSKP43235 329 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 UCNP55089 124 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 NFIL3Q16649 462 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 FBXL19Q6PCT2 694 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 RDH13Q8NBN7 331 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 UCMAQ8WVF2 138 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CPNE5Q9HCH3 593 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PDE11AQ9HCR9 933 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 DMAC2Q9NW81 257 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PLK2Q9NYY3 685 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CLDN5O00501 218 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 NR3C1P04150 777 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ABCB4P21439 1286 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ACADVLP49748 655 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CSRP3P50461 194 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 COPAP53621 1224 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 C21orf59P57076 290 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 STIM1Q13586 685 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PSMD6Q15008 389 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PLXNA2O75051 1894 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 COL12A1Q99715 3063 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 A0A1B0GTQ1 180 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 FSBPO95073 299 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ITGAVP06756 1048 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 GLDCP23378 1020 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 ACSL1P33121 698 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PRCPP42785 496 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 CYP24A1Q07973 514 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 GOLGA8FQ08AF8 430 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED1-205ENST00000515319 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms