RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 M0QYT0 321 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 ENGP17813 658 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TGM1P22735 817 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 GRIA3P42263 894 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 TUBP50607 506 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MIIPQ5JXC2 388 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 NAA35Q5VZE5 725 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf89Q6UX73 402 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRC-212ENST00000491302 LMTK3Q96Q04 1460 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 VWA3AA6NCI4 1184 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CYP21A2P08686 494 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FAM163BP0C2L3 166 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 DUSP1P28562 367 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 DIO1P49895 249 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RCAN1P53805 252 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 MPP3Q13368 585 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ANO7Q6IWH7 933 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TCP11L2Q8N4U5 519 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FSD1LQ9BXM9 530 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 USP29Q9HBJ7 922 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TBX20Q9UMR3 447 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 MAKP20794 623 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PCSK6P29122 969 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PNPLA4P41247 253 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 JAK3P52333 1124 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 DGCR2P98153 550 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LMAN2Q12907 356 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FBLN7Q53RD9 439 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A6Q92581 669 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CAVIN3Q969G5 261 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SNX18Q96RF0 628 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CDCP1Q9H5V8 836 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PREBQ9HCU5 417 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 IRAK4Q9NWZ3 460 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SUFUQ9UMX1 484 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 AGAP5A6NIR3 686 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 B4E171 279 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SUV39H1O43463 412 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ESRRBO95718 433 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CD4P01730 458 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 EBLN1P0CF75 366 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CPA1P15085 419 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN7P41732 249 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RXRGP48443 463 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CBWD5Q5RIA9 395 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 DSTYKQ6XUX3 929 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC8DQ7L1W4 858 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ACTRT2Q8TDY3 377 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 NPAS1Q99742 590 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 SWAP70Q9UH65 585 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 TTC34A8MYJ7 566 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 H0YIZ8 118 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 ANP32CO43423 234 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 C1RP00736 705 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CHN1P15882 459 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CYP3A7P24462 503 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 CXCR5P32302 372 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 PGM1P36871 562 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRC-212ENST00000491302 FOXL2P58012 376 aa8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms