RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490437.5

SRI-210, Transcript of sorcin, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRI, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRI-210ENST00000490437 SORCS3Q9UPU3 1222 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 LZTS1Q9Y250 596 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 KIF3AQ9Y496 699 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 SZT2Q5T011 3432 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 FRMPD4Q14CM0 1322 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 DOCK3Q8IZD9 2030 aa2.9□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 A0A0U1RQF3 1178 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ESYT2A0FGR8 921 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GOLGA6CA6NDK9 693 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GOLGA6BA6NDN3 693 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CCDC169A6NNP5 214 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 HIDE1A8MVS5 230 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PRRG1O14668 218 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 INPPL1O15357 1258 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NCAM2O15394 837 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MSH4O15457 936 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ASAP2O43150 1006 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TRAPPC3O43617 180 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NEMFO60524 1076 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 USO1O60763 962 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 KINO60870 393 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TDP2O95551 362 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 C22orf31O95567 290 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 EYA4O95677 639 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CCNE2O96020 404 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GOLGA6DP0CG33 693 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CPA1P15085 419 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 AOAHP28039 575 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 AVPR2P30518 371 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 YWHABP31946 246 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CSF2RBP32927 897 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MLH1P40692 756 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ETV4P43268 484 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GLUD2P49448 558 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GPC3P51654 580 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 STRN3Q13033 797 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TDGQ13569 410 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NFYCQ13952 458 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 USP10Q14694 798 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GPNMBQ14956 572 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 UBXN2BQ14CS0 331 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 EMC2Q15006 297 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NECTIN1Q15223 517 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TCEA2Q15560 299 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MAPK6Q16659 721 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PPM1LQ5SGD2 360 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MARCH8Q5T0T0 291 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 HAUS3Q68CZ6 603 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PDXDC1Q6P996 788 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 SPATC1Q76KD6 591 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 RUFY3Q7L099 469 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PALB2Q86YC2 1186 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NUDT10Q8NFP7 164 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 SH3RF2Q8TEC5 729 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ATRIPQ8WXE1 791 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 AUTS2Q8WXX7 1259 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 LPPQ93052 612 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TMEM143Q96AN5 459 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CCDC51Q96ER9 411 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 BICD1Q96G01 975 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 NUDT11Q96G61 164 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 FAM20AQ96MK3 541 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 GCNAQ96QF7 691 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CTAGE1Q96RT6 745 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 PCYT2Q99447 389 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 KCNJ15Q99712 375 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 CDC6Q99741 560 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 SH2D3AQ9BRG2 576 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 LXNQ9BS40 222 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 TMEM175Q9BSA9 504 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 DHRS4Q9BTZ2 278 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ZMYND12Q9H0C1 365 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 C2orf40Q9H1Z8 148 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 IL25Q9H293 177 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 UNC45AQ9H3U1 944 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ZHX3Q9H4I2 956 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 POMKQ9H5K3 350 aa2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
SRI-210ENST00000490437 MAN1C1Q9NR34 630 aa2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms