RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489537.5

SF3A3-208, Transcript of splicing factor 3a subunit 3, humanhuman

TSL 4

Gene SF3A3, Length 891 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3-208ENST00000489537 LZTR1Q8N653 840 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 C12orf29Q8N999 325 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 JOSD2Q8TAC2 188 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RAPGEF5Q92565 580 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NT5C3BQ969T7 300 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RTP4Q96DX8 246 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FAM84AQ96KN4 292 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 VAT1Q99536 393 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NAT9Q9BTE0 207 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TXLNGYQ9BZA5 131 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CHST7Q9NS84 486 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 KRT82Q9NSB4 513 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MTMR10Q9NXD2 777 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NR2E1Q9Y466 385 aa6.6□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MUC3AQ02505 3323 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 H7C0C1 242 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 AGPSO00116 658 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PPEF2O14830 753 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PSMD3O43242 534 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RIPK2O43353 540 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LILRA1O75019 489 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TADA2AO75478 443 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CALCAP01258 141 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 IFNB1P01574 187 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LTFP02788 710 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ALDH2P05091 517 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FAM153BP0C7A2 387 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LCP1P13796 627 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CCDC130P13994 396 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FLT3P36888 993 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ATP5OP48047 213 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 KCNJ1P48048 391 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RGS7P49802 495 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SULT1E1P49888 294 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CDK7P50613 346 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 OGDHQ02218 1023 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TLE2Q04725 743 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 DSC1Q08554 894 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ADIGQ0VDE8 80 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GPS1Q13098 491 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SNX1Q13596 522 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 DPYSL3Q14195 570 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 HIF1AQ16665 826 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 KLHL38Q2WGJ6 581 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FAM153CQ494X1 144 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 DCAF6Q58WW2 860 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 LGSNQ5TDP6 509 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF280DQ6N043 979 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RHBDF2Q6PJF5 856 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ZDHHC24Q6UX98 284 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 MICALCLQ6ZW33 695 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TDRPQ86YL5 185 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TDHQ8IZJ6 230 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 VWA5B2Q8N398 1253 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 SVOPQ8N4V2 548 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 EMC1Q8N766 993 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RNF169Q8NCN4 708 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 HSPH1Q92598 858 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 BADQ92934 168 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 CENPTQ96BT3 561 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 VWCEQ96DN2 955 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 FAM161BQ96MY7 647 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 GUCD1Q96NT3 240 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 NPY6RQ99463 290 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 TRIM7Q9C029 511 aa6.59□□□□□ -1.35
SF3A3-208ENST00000489537 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms