RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATG2BQ96BY7 2078 aa20.57■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IRAK2O43187 625 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACSL4O60488 711 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRAP2O75791 330 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ERBB2P04626 1255 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC6A3Q01959 620 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 E2F5Q15329 346 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAF5Q15542 800 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRY1Q16526 586 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHPFQ8IZ52 775 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SUMF1Q8NBK3 374 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UCMAQ8WVF2 138 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF34Q969K3 372 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AZIN2Q96A70 460 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C18orf8Q96DM3 657 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STARD13Q9Y3M8 1113 aa20.56■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPHB6O15197 1021 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAVIN2O95810 425 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMEP08473 750 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CISD3P0C7P0 127 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC2A3P11169 496 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 JAM2P57087 298 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDR2Q01850 454 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARID5AQ03989 594 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANO7Q6IWH7 933 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEFB106AQ8N104 65 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDIT4Q9NX09 232 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COX16Q9P0S2 106 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EBF1Q9UH73 591 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXO10Q9UK96 956 aa20.55■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SGK1O00141 431 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HRO43593 1189 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SERPINC1P01008 464 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC172P0C7W6 258 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NTSR1P30989 418 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LPAL2Q16609 132 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NAA35Q5VZE5 725 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAB3Q8WWW8 586 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC2A13Q96QE2 648 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FUCA2Q9BTY2 467 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FANCMQ8IYD8 2048 aa20.54■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FRYLO94915 3013 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM186AA6NE01 2351 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANTXRLA6NF34 631 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRRT4C9JH25 899 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DAB1O75553 588 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXB2P14652 356 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABCB4P21439 1286 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HOXC13P31276 330 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCR1P32246 355 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LAIR1Q6GTX8 287 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGBD3Q8N328 593 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC20A1Q8WUM9 679 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC39A13Q96H72 371 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTN2A3PQ96KV6 586 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CIPCQ9C0C6 399 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRN3Q9NYV6 651 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms