RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK16Q00536 496 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 SEMA5AQ13591 1074 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 DPYSQ14117 519 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC26Q2I0M4 334 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 SYPL2Q5VXT5 272 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 CYTH2Q99418 400 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 TBK1Q9UHD2 729 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM47DPA6NHR8 397 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 YJEFN3A6XGL0 299 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 E7ENQ6 273 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 STK10O94804 968 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM189BP81408 668 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 SEMA3BQ13214 749 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 PDK1Q15118 436 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 ARL13BQ3SXY8 428 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAF7Q6Q0C0 670 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 C6orf89Q6UWU4 347 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 HFE2Q6ZVN8 426 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 BHLHA9Q7RTU4 235 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF169Q8NCN4 708 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 CKAP2Q8WWK9 683 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGVQ9NUD9 493 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP290O15078 2479 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 STX2P32856 288 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 MAGEA3P43357 314 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 TSPY1Q01534 308 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 GLB1LQ6UWU2 654 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC24A5Q71RS6 500 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CNPY4Q8N129 248 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 HTR3CQ8WXA8 447 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC16BQ96JE7 1060 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 BRD8Q9H0E9 1235 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNK9Q9NPC2 374 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 FBXW11Q9UKB1 542 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 NLRC5Q86WI3 1866 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0A0MRY4 1105 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SSTR1P30872 391 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 ELK3P41970 407 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 OVOS1Q6IE37 1185 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC7A14Q8TBB6 771 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 FBF1Q8TES7 1133 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA13Q96N96 652 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SMC6Q96SB8 1091 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNK16Q96T55 309 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 FTHL17Q9BXU8 183 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 TRABDQ9H4I3 376 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 ETNK1Q9HBU6 452 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 KANSL3Q9P2N6 904 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 NCAM2O15394 837 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 OPHN1O60890 802 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 BANF1O75531 89 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA0754O94854 1291 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 BRCC3P46736 316 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SARNPP82979 210 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 DSC1Q08554 894 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 C4orf50Q6ZRC1 276 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 RFX8Q6ZV50 586 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGWQ7Z7B1 504 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PYROXD2Q8N2H3 581 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 MAGEB18Q96M61 343 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 HTATIP2Q9BUP3 242 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM30AQ9NV96 361 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PHF24Q9UPV7 400 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1W2PQY0 241 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 DCLK1O15075 740 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 MLNP12872 115 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CREB1P16220 341 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP2C18P33260 490 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CXCR3P49682 368 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CACNA2D1P54289 1103 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 NRLP54845 237 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 ITIH4Q14624 930 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 QPCTQ16769 361 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC110Q8TBZ0 833 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 URGCPQ8TCY9 931 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PAFAH2Q99487 392 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 CHMP2BQ9UQN3 213 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 MFSD11O43934 449 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 USP17L7P0C7H9 530 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 NCAM1P13591 858 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT15P19012 456 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 MSH2P43246 934 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 NME3Q13232 169 aa19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms