RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 FOXJ1Q92949 421 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ACOX2Q99424 681 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CGRRF1Q99675 332 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 NRSN2Q9GZP1 204 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa10.64□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 FBN2P35556 2912 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ITPR2Q14571 2701 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 LEFTY2O00292 366 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 PES1O00541 588 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 EPHB6O15197 1021 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 P4HA2O15460 535 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 NOL4O94818 638 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CYP11A1P05108 521 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CSH1P0DML2 217 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CSH2P0DML3 217 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 HDCP19113 662 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GTF2H1P32780 548 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GRIA2P42262 883 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.63□□□□□ -0.715e-10■■□□□ 12.9
ATG4B-211ENST00000429899 GRK6P43250 576 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 MXI1P50539 228 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 NFKB2Q00653 900 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM14Q14142 442 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ARID5BQ14865 1188 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TBC1D25Q3MII6 688 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ERICH1Q86X53 443 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 MYRFLQ96LU7 910 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GANQ9H2C0 597 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 SIX2Q9NPC8 291 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 FTSJ1Q9UET6 329 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CACNA1DQ01668 2161 aa10.63□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GVT2 93 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1W2PQJ5 194 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 LACTBL1A8MY62 500 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 KCNK3O14649 394 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM24O15164 1050 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 MFAP3LO75121 409 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CYP3A5P20815 502 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GCLMP48507 274 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 UCNP55089 124 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GSDMDP57764 484 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 KYAT1Q16773 422 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 HES3Q5TGS1 186 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC186Q7Z3E2 898 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 DRC7Q8IY82 874 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 NAT16Q8N8M0 369 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TC2NQ8N9U0 490 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF248Q8NDW4 579 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 LMO3Q8TAP4 145 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 FAM84AQ96KN4 292 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 MRGPRX1Q96LB2 322 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 KCNF1Q9H3M0 494 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM8AQ9HCN3 771 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 PDE11AQ9HCR9 933 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 PLCB1Q9NQ66 1216 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 COQ4Q9Y3A0 265 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 RAD54BQ9Y620 910 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 DOCK9Q9BZ29 2069 aa10.62□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 KIF26BQ2KJY2 2108 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TBC1D3BA6NDS4 549 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CBX4O00257 560 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 PIRO00625 290 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 STX10O60499 249 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 IL18RAPO95256 599 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CLTAP09496 248 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 FECHP22830 423 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CYP2F1P24903 491 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 PON1P27169 355 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 NTSR1P30989 418 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 EXOC3L4Q17RC7 722 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC142Q17RM4 750 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ZACNQ401N2 412 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 DCAF12L1Q5VU92 463 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 WSCD1Q658N2 575 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 TRIM65Q6PJ69 517 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 GBP6Q6ZN66 633 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ATG14Q6ZNE5 492 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 WDR49Q8IV35 697 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF516Q92618 1163 aa10.61□□□□□ -0.71
ATG4B-211ENST00000429899 IQCDQ96DY2 449 aa10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.2 ms