RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 USP6NLQ92738 828 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CDCA5Q96FF9 252 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF778Q96MU6 729 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF157Q96PX1 679 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ELOVL4Q9GZR5 314 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SIX4Q9UIU6 781 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa18.91■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 TXNDC9O14530 226 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 B4GALT5O43286 388 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 MAFO75444 373 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 KLHL2O95198 593 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 HMGCRP04035 888 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SMIM18P0DKX4 95 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CXCL8P10145 99 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 PDGFRAP16234 1089 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 STAT5BP51692 787 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 COPAP53621 1224 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 BTKQ06187 659 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 TFDP2Q14188 446 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 MYBPC3Q14896 1274 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ARCQ7LC44 396 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 MPP5Q8N3R9 675 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 RXFP2Q8WXD0 754 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 BCO2Q9BYV7 579 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT38O76015 456 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 IL4RP24394 825 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 GPD2P43304 727 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 USP46P62068 366 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 FOLH1Q04609 750 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT81Q14533 505 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ACTRT2Q8TDY3 377 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 SIKE1Q9BRV8 207 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 KLC2Q9H0B6 622 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 GALNT8Q9NY28 637 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 HSFX1Q9UBD0 423 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 CDH22Q9UJ99 828 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA11Q9UKX5 1188 aa18.9■□□□□ 0.62
RALGPS1-208ENST00000424082 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPSAP2O60256 369 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PGM3O95394 542 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PCNTO95613 3336 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBED1O96006 694 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PROCP04070 461 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GJB1P08034 283 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ITGA2BP08514 1039 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RAG1P15918 1043 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GPD1P21695 349 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 L1CAMP32004 1257 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 RGS2P41220 211 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 GABRB2P47870 512 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ACAP1Q15027 740 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SURF1Q15526 300 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SCYL2Q6P3W7 929 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PQLC3Q8N755 202 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 BTBD9Q96Q07 612 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 MMP19Q99542 508 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CNPY3Q9BT09 278 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PTTG2Q9NZH5 202 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ITM2AO43736 263 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX1O43933 1283 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 SERPINB6P35237 376 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 BCAR1P56945 870 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ARPINQ7Z6K5 226 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRF2Q8IZF7 708 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf127Q8N9H9 656 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ICA1LQ8NDH6 482 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 HIPK4Q8NE63 616 aa18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 C2CD4BA6NLJ0 364 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 VILLO15195 856 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 NFICP08651 508 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF534Q76KX8 674 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 CCDC33Q8N5R6 958 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.88■□□□□ 0.61
RALGPS1-208ENST00000424082 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms