RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BNC1Q01954 994 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAB41Q5JT25 222 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM215Q68D42 235 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGZQ86VD9 579 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDI1Q8WTU0 396 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SORCS1Q8WY21 1168 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLD4Q96BZ4 506 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUP58Q9BVL2 599 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A11Q9BYW1 496 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM7SF3Q9NS93 570 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP25Q9UHP3 1055 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCOR1Q9UKL0 485 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPSM3Q9Y4H4 160 aa13.79□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GVL5 298 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID5AQ03989 594 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-BQ31612 363 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT39Q6A163 491 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO6A1Q86UG4 719 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC39CQ8N584 583 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC4A11Q8NBS3 891 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2T3Q8NH03 318 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf216Q8TAB5 229 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX21Q969T3 373 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM176AQ96HP8 235 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBXN6Q9BZV1 441 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCED1AQ9H1Q7 454 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HPSEQ9Y251 543 aa13.78□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM131Q92545 1883 aa13.77□□□□□ -0.2
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLRT2O43155 660 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOBTB3O94955 611 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-EP13747 358 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL13P26373 211 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MXI1P50539 228 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC8A3P57103 927 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKP1Q13835 747 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM124AQ86V42 546 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX19Q92543 992 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID3AQ99856 593 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LHX5Q9H2C1 402 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CISHQ9NSE2 258 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC400499M0QZD8 3231 aa13.77□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GVT2 93 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TIMM44O43615 452 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBED1O96006 694 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CMA1P23946 247 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HLA-FP30511 346 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF2H1P32780 548 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TKTL1P51854 596 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAD23BP54727 409 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAM9Q13443 819 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPPE1Q53F39 396 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf48Q6RUI8 117 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DBX2Q6ZNG2 339 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BHLHA9Q7RTU4 235 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FMNL3Q8IVF7 1028 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MDM1Q8TC05 714 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEMA4DQ92854 862 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ULBP1Q9BZM6 244 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOR4AQ9NXH8 423 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUMA1Q14980 2115 aa13.76□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FASNP49327 2511 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DKK1O94907 266 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C7P10643 843 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSL1P33121 698 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HARS2P49590 506 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF445P59923 1031 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCWPW2Q504Y3 356 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PM20D1Q6GTS8 502 aa13.75□□□□□ -0.21
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms