RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 GGA3Q9NZ52 723 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 STEAP1Q9UHE8 339 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CNTN6Q9UQ52 1028 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF804BA4D1E1 1349 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 GXYLT2A0PJZ3 443 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 PRRT4C9JH25 899 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 SMIM22K7EJ46 135 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 EYA2O00167 538 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 EXOC5O00471 708 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF213O14771 459 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 POLBP06746 335 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 FESP07332 822 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 CD19P15391 556 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ENGP17813 658 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 PROSER3Q2NL68 480 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 RRAGAQ7L523 313 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 TMTC1Q8IUR5 882 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CPOQ8IVL8 374 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 XAGE5Q8WWM1 108 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CTHRC1Q96CG8 243 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 G6PC2Q9NQR9 355 aa3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 PRR35P0CG20 571 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 TUBA4AP68366 448 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 KCNJ12Q14500 433 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 ST3GAL2Q16842 350 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 MTX3Q5HYI7 312 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
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PTPRC-207ENST00000418674 GLCCI1Q86VQ1 547 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 OR4N4Q8N0Y3 316 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 AFG1LQ8WV93 481 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 CPT1BQ92523 772 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-207ENST00000418674 C3orf49Q96BT1 292 aa3.29□□□□□ -1.88
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