RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 BAP1Q92560 729 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 MPOP05164 745 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 NPY2RP49146 381 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNMB4Q86W47 210 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 NMRK1Q9NWW6 199 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 SIGLEC16A6NMB1 481 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 WNT7AO00755 349 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 NFICP08651 508 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 BDNFP23560 247 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 RBL1P28749 1068 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 SCUBE1Q8IWY4 988 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 CIPCQ9C0C6 399 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF19AQ9NV58 838 aa21.95■■□□□ 1.11
PTPRJ-201ENST00000418331 A0A0U1RQJ8 604 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PRR23AA6NEV1 266 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 UBOX5O94941 541 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 USP17L7P0C7H9 530 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 WLSQ5T9L3 541 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 YIPF2Q9BWQ6 316 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 TAGLN3Q9UI15 199 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ITM2BQ9Y287 266 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 TPBGLP0DKB5 382 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 GRTP1Q5TC63 336 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PPP4R4Q6NUP7 873 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SHC3Q92529 594 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ADAM2Q99965 735 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP13A1Q9HD20 1204 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 HES6Q96HZ4 224 aa21.95■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 CYP1A2P05177 515 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 MYL4P12829 197 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 MTA1Q13330 715 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 AADACL2Q6P093 401 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS50Q96JG6 964 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 CDT1Q9H211 546 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 NME5P56597 212 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 DPYSL3Q14195 570 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC39A12Q504Y0 691 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SERPINB10P48595 397 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 RAP1GDS1P52306 607 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 TKTL2Q9H0I9 626 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ITGA9Q13797 1035 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SPANXN3Q5MJ09 141 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SLC22A9Q8IVM8 553 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 INPP5DQ92835 1189 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 TNFRSF25Q93038 417 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PGM2Q96G03 612 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 APOPT1Q96IL0 206 aa21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 KCNA4P22459 653 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 DTNAQ9Y4J8 743 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 MYPNQ86TC9 1320 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 HPCAP84074 193 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 BMT2Q1RMZ1 405 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 VAT1Q99536 393 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 VAPBO95292 243 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 NOS2P35228 1153 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PRIM2P49643 509 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ARMC6Q6NXE6 501 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 WNT8BQ93098 351 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 C10orf88Q9H8K7 445 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ECM1Q16610 540 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PDPK2PQ6A1A2 396 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 CES3Q6UWW8 571 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 PLEKHA8Q96JA3 519 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 APPL1Q9UKG1 709 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 HES2Q9Y543 173 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ALBP02768 609 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SCNN1GP51170 649 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 WSCD1Q658N2 575 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms