RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 CFAP57Q96MR6 1250 aa24.78■■□□□ 1.56
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UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa24.78■■□□□ 1.56
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UBE2E3-202ENST00000410062 KRT3P12035 628 aa24.77■■□□□ 1.56
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UBE2E3-202ENST00000410062 ARCQ7LC44 396 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 C3orf20Q8ND61 904 aa24.77■■□□□ 1.56
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UBE2E3-202ENST00000410062 SELENOOQ9BVL4 669 aa24.77■■□□□ 1.56
UBE2E3-202ENST00000410062 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
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UBE2E3-202ENST00000410062 FTLP02792 175 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 SLC6A4P31645 630 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RPS9P46781 194 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 LRRC32Q14392 662 aa24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RFWD3Q6PCD5 774 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR59Q6PJI9 974 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 Q6ZS52 159 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DTWD2Q8NBA8 298 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DDI1Q8WTU0 396 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 RXFP2Q8WXD0 754 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PNKPQ96T60 521 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PIGVQ9NUD9 493 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CACNG3O60359 315 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PENKP01210 267 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 CCR1P32246 355 aa24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC24Q6P3W2 148 aa24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 SFTPA1Q8IWL2 248 aa24.76■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 VCPIP1Q96JH7 1222 aa24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 KCNU1A8MYU2 1149 aa24.75■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
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UBE2E3-202ENST00000410062 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP11AP98196 1134 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DEUP1Q05D60 604 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ARID5BQ14865 1188 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 BTN2A3PQ96KV6 586 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CHRDQ9H2X0 955 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DEC1Q9P2X7 70 aa24.75■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 A0A087X0T9 212 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 GFRA2O00451 464 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 KAT7O95251 611 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM228BP0C875 321 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC2A3P11169 496 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 GAS6Q14393 721 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PPP2R5DQ14738 602 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC14Q49A88 953 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MPPE1Q53F39 396 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 DRC7Q8IY82 874 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 PHTF2Q8N3S3 785 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa24.74■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ANTXRLA6NF34 631 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 APODP05090 189 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCB4P21439 1286 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 SDC4P31431 198 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGEA9P43362 315 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CXCR3P49682 368 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 MTAPQ13126 283 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 CDO1Q16878 200 aa24.73■■□□□ 1.55
UBE2E3-202ENST00000410062 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
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