RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 DLGAP5Q15398 846 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 RFX6Q8HWS3 928 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRF4Q8IZF3 695 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 GJA10Q969M2 543 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 MDFICQ9P1T7 246 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 MATN1P21941 496 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 CD93Q9NPY3 652 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 RXFP3Q9NSD7 469 aa4.54□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 EGR4Q05215 589 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 KEAP1Q14145 624 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.53□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 KAT2BQ92831 832 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRK-202ENST00000368205 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
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PTPRK-202ENST00000368205 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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PTPRK-202ENST00000368205 NR4A3Q92570 626 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRK-202ENST00000368205 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
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PTPRK-202ENST00000368205 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-202ENST00000368205 MAP3K1Q13233 1512 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-202ENST00000368205 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRK-202ENST00000368205 NCAPD3P42695 1498 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-202ENST00000368205 SETD5Q9C0A6 1442 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRK-202ENST00000368205 ENO1P06733 434 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
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