RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 MDM4O15151 490 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM225BP0DP42 221 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 KLRC1P26715 233 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CXCR3P49682 368 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DLX5P56178 289 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 GAD2Q05329 585 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 KIF5AQ12840 1032 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGEF7Q14155 803 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DDIASQ8IXT1 998 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HES6Q96HZ4 224 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 GABBR1Q9UBS5 961 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 CPA1P15085 419 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 NCLP19338 710 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HTR1BP28222 390 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 HOXD12P35452 270 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 MTAPQ13126 283 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 DAAM2Q86T65 1068 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 GJA10Q969M2 543 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ISCUQ9H1K1 167 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PLAC1Q9HBJ0 212 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 VPS4AQ9UN37 437 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-202ENST00000367364 COL15A1P39059 1388 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GVT2 93 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 BECN2A8MW95 431 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TBX3O15119 743 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RBL1P28749 1068 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TAF6P49848 677 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF84P51523 738 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 CLCN5P51795 746 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 EVA1CP58658 441 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 P3H2Q8IVL5 708 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 HTATIP2Q9BUP3 242 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 STK32BQ9NY57 414 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DKK4Q9UBT3 224 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RASSF9O75901 435 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SP1P08047 785 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 NDUFS1P28331 727 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ISM2Q6H9L7 571 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 PARM1Q6UWI2 310 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 B3GNT9Q6UX72 402 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 IL31RAQ8NI17 732 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 KAT2BQ92831 832 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TASP1Q9H6P5 420 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DTX4Q9Y2E6 619 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DENND3A2RUS2 1198 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM43BA6NCK2 446 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 PRR23AA6NEV1 266 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 OR6C75A6NL08 312 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RGS14O43566 566 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 CPT1AP50416 773 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ABATP80404 500 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 GPS2Q13227 327 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 GPSM1Q86YR5 675 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC136Q96JN2 1154 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RAB27BO00194 218 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 SNX2O60749 519 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 UBXN7O94888 489 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 WDR47O94967 919 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 ACVR2AP27037 513 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 DUSP1P28562 367 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 KCNAB1Q14722 419 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRC-202ENST00000367364 LIPMQ5VYY2 423 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms