RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 SKP1P63208 163 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ST3GAL1Q11201 340 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 NME3Q13232 169 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRB-202ENST00000334414 ARHGEF7Q14155 803 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 OVOS2Q6IE36 1432 aa5.65□□□□□ -1.5
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PTPRB-202ENST00000334414 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 RPN2P04844 631 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 KCNN2Q9H2S1 579 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 ETS1P14921 441 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 POLD2P49005 469 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 MGAT5Q09328 741 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 EEF2KMTQ96G04 330 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 C12orf66Q96MD2 445 aa5.65□□□□□ -1.51
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PTPRB-202ENST00000334414 KLHL1Q9NR64 748 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 PRELID1Q9Y255 219 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 NR5A2O00482 541 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-202ENST00000334414 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
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