RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 BBS5Q8N3I7 341 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 LRGUKQ96M69 825 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 MSTO1Q9BUK6 570 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CYP4F11Q9HBI6 524 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 FBXO28Q9NVF7 368 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 RHBDL2Q9NX52 303 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 USP18Q9UMW8 372 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 SQORQ9Y6N5 450 aa11.61□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 G3V3G9 751 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PRKCGP05129 697 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ZNF23P17027 643 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TGM2P21980 687 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PROZP22891 400 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CAP2P40123 477 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ALDH3B2P48448 385 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CDK9P50750 372 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 APLP1P51693 650 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 RAB15P59190 212 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TGFB2P61812 414 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 KLF10Q13118 480 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 DENND1BQ6P3S1 775 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 EPGNQ6UW88 154 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ATG14Q6ZNE5 492 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 BRSK2Q8IWQ3 736 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PHTF2Q8N3S3 785 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ATP2A3Q93084 1043 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 MMP19Q99542 508 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 HAUS8Q9BT25 410 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CALN1Q9BXU9 219 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CDY1Q9Y6F8 540 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ATP6V1G1O75348 118 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TOMM70O94826 608 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CST3P01034 146 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 GLDCP23378 1020 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ARRB2P32121 409 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TAF5Q15542 800 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PIGGQ5H8A4 983 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 C16orf89Q6UX73 402 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 MAP7D3Q8IWC1 876 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PLD5Q8N7P1 536 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 HIPK4Q8NE63 616 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 GPRASP2Q96D09 838 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 RNF157Q96PX1 679 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PDCD2LQ9BRP1 358 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PNPOQ9NVS9 261 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PCDHGB4Q9UN71 923 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa11.6□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ZNF487B1APH4 448 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 H7C0C1 242 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 KCNN4O15554 427 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 MED7O43513 233 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ZBTB14O43829 449 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 GCATO75600 419 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 APRTP07741 180 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 THRAP10827 490 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 IDO1P14902 403 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 NPR1P16066 1061 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 NAMPTP43490 491 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ATP5OP48047 213 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 CD97P48960 835 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 NIPAL4Q0D2K0 466 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 LPIN1Q14693 890 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 PDK2Q15119 407 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 ZNF423Q2M1K9 1284 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 KLHL35Q6PF15 583 aa11.59□□□□□ -0.55
GINS3-202ENST00000328514 NPNTQ6UXI9 565 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms