RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317221.11

ZNF559-201, Transcript of zinc finger protein 559, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF559, Length 2,732 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559-201ENST00000317221 CD1EP15812 388 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 EPHA3P29320 983 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 BMXP51813 675 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 RHBDL3P58872 404 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 CTBSQ01459 385 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 ZBED5Q49AG3 693 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 DACT2Q5SW24 774 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 C6orf183Q5T699 404 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 KRT80Q6KB66 452 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 NEPROQ6NW34 567 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 C16orf46Q6P387 395 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 PADI6Q6TGC4 694 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 MAVSQ7Z434 540 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 HAUS6Q7Z4H7 955 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 C12orf56Q8IXR9 622 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 CHPT1Q8WUD6 406 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 ERLEC1Q96DZ1 483 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 COA1Q9GZY4 146 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 COQ10BQ9H8M1 238 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 BCAP29Q9UHQ4 241 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 CDC14AQ9UNH5 594 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 SCINQ9Y6U3 715 aa5.9□□□□□ -1.46
ZNF559-201ENST00000317221 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 CLRN2A0PK11 232 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TMEM191CA6NGB0 347 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GIPC1O14908 333 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 MCF2LO15068 1137 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 NDUFB5O43674 189 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 ZBTB14O43829 449 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 SPAG6O75602 509 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 BAIAP3O94812 1187 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GSRP00390 522 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 C1QAP02745 245 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TMEM191BP0C7N4 346 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 CYP2C9P11712 490 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 UGT1A6P19224 532 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 UGT1A1P22309 533 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 UGT1A4P22310 534 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 UGT1A3P35503 534 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 UGT1A5P35504 534 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 THOP1P52888 689 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GCNT1Q02742 428 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 KLF10Q13118 480 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 ITGADQ13349 1161 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 CYP2A13Q16696 494 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 LRRC38Q5VT99 294 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 MBLAC2Q68D91 279 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TATDN1Q6P1N9 297 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 DSELQ8IZU8 1212 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 KYQ8NBH2 561 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 SGF29Q96ES7 293 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 AMNQ9BXJ7 453 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 NACA2Q9H009 215 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GBA3Q9H227 469 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GPRC5CQ9NQ84 441 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TRPV5Q9NQA5 729 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 SLC8A2Q9UPR5 921 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.9□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 HMX2A2RU54 273 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GOLGA8TH3BQL2 631 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 ZNF195O14628 629 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 KLHL41O60662 606 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 GAS7O60861 476 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 SULT1C4O75897 302 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 BMP10O95393 424 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 ESRRBO95718 433 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 INHBBP09529 407 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 SERPINB5P36952 375 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 NUDT2P50583 147 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 PKNOX1P55347 436 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 PEX3P56589 373 aa5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ZNF559-201ENST00000317221 NOMO3P69849 1222 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms