RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 DDIT4Q9NX09 232 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 COL4A6Q14031 1691 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ALOX15BO15296 676 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 HOXA2O43364 376 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 BASP1P80723 227 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 IKBKEQ14164 716 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 EPN3Q9H201 632 aa22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 KCNN4O15554 427 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 LBX1P52954 281 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PCGF5Q86SE9 256 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ARMC5Q96C12 935 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.1■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FAM72CH0Y354 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TCEA3O75764 348 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ABHD2P08910 425 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 GCAP28676 217 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 HIF1AQ16665 826 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FAM72AQ5TYM5 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FAM72DQ6L9T8 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FAM72BQ86X60 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 LRRC43Q8N309 656 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CRISPLD1Q9H336 500 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa22.09■■□□□ 1.13
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SOX17-201ENST00000297316 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 ZNF487B1APH4 448 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CREB3O43889 395 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CHN1P15882 459 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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SOX17-201ENST00000297316 ZNF280DQ6N043 979 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CENPUQ71F23 418 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TAC4Q86UU9 113 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 EURLQ9NYK6 297 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 TBK1Q9UHD2 729 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 SNX10Q9Y5X0 201 aa22.09■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 CSF2RAP15509 400 aa22.08■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 GPX6P59796 221 aa22.08■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 USP46P62068 366 aa22.08■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.08■■□□□ 1.13
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SOX17-201ENST00000297316 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SOX17-201ENST00000297316 DGKIO75912 1065 aa22.08■■□□□ 1.12
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SOX17-201ENST00000297316 ADRA1BP35368 520 aa22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 DEFB103AP81534 67 aa22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 SCD5Q86SK9 330 aa22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
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SOX17-201ENST00000297316 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CWH43Q9H720 699 aa22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.08■■□□□ 1.12
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SOX17-201ENST00000297316 STAT4Q14765 748 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
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SOX17-201ENST00000297316 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NLRP14Q86W24 1093 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 RNF139Q8WU17 664 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 OSER1Q9NX31 292 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 LTBP2Q14767 1821 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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SOX17-201ENST00000297316 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 LGALS13Q9UHV8 139 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.07■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 NDUFAB1O14561 156 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ACRP10323 421 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ARL4AP40617 200 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ARL4CP56559 192 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 CCDC110Q8TBZ0 833 aa22.06■■□□□ 1.12
SOX17-201ENST00000297316 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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