RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 UBE2E3Q969T4 207 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MAML3Q96JK9 1138 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 APOL4Q9BPW4 351 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NFKBIZQ9BYH8 718 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SMIM22K7EJ46 135 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KPNA5O15131 536 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RGS14O43566 566 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DGKIO75912 1065 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FGF19O95750 216 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 UQCRBP14927 111 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ITGB6P18564 788 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CDC16Q13042 620 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PEX6Q13608 980 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GALNTL6Q49A17 601 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MICU2Q8IYU8 434 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DLG3Q92796 817 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FAM205AQ6ZU69 1335 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BTNL10A8MVZ5 291 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NR5A2O00482 541 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NBNO60934 754 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MTA2O94776 668 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MICAL2O94851 1124 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ALDH2P05091 517 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SERPINF2P08697 491 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 EPHX2P34913 555 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SERPINB5P36952 375 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 EFEMP1Q12805 493 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 EPS8Q12929 822 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 UNC93AQ86WB7 457 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 IFNEQ86WN2 208 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 EID3Q8N140 333 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CPB2Q96IY4 423 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 YME1L1Q96TA2 773 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 IL1RL2Q9HB29 575 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PARVBQ9HBI1 364 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 QSOX1O00391 747 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MYL4P12829 197 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 HPGDP15428 266 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TARSP26639 723 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TALDO1P37837 337 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RPL3P39023 403 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BTKQ06187 659 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GRIK3Q13003 919 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 TSNQ15631 228 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PKN1Q16512 942 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DDR2Q16832 855 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NT5DC3Q86UY8 548 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 BRSK2Q8IWQ3 736 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ZNF786Q8N393 782 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CCDC3Q9BQI4 270 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SPG21Q9NZD8 308 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SORCS3Q9UPU3 1222 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DISP2A7MBM2 1401 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 ARP10275 920 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 AKR1A1P14550 325 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RAP1GAPP47736 663 aa7.39□□□□□ -1.23
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CPS1-201ENST00000233072 RCN1Q15293 331 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CNGA2Q16280 664 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MARC1Q5VT66 337 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KCNMB4Q86W47 210 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RXFP2Q8WXD0 754 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 THAP1Q9NVV9 213 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 MBD2Q9UBB5 411 aa7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 NFASCO94856 1347 aa7.38□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 CHADO15335 359 aa7.38□□□□□ -1.23
CPS1-201ENST00000233072 RAMP2O60895 175 aa7.38□□□□□ -1.23
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