RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 LCMT1Q9UIC8 334 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 GOLGA8RI6L899 631 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TNFRSF10BO14763 440 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 GAS8O95995 478 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 VAV1P15498 845 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 FNBP1LQ5T0N5 605 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TXNDC8Q6A555 127 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ATP2A3Q93084 1043 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 IGSF21Q96ID5 467 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RUFY1Q96T51 708 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CHMP2BQ9UQN3 213 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 HGSO14964 777 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TPH1P17752 444 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ERVFC1P60507 584 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NTHL1P78549 312 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TAF12Q16514 161 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CCNG2Q16589 344 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ALFQ53S48 1182 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PLPP4Q5VZY2 271 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RAP1GAP2Q684P5 730 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 KLHL23Q8NBE8 558 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NAT14Q8WUY8 206 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 EXOC2Q96KP1 924 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 SMIM14Q96QK8 99 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TRAIPQ9BWF2 469 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RNF38Q9H0F5 515 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PCYOX1Q9UHG3 505 aa6.81□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 MICAL3Q7RTP6 2002 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 SLC12A8A0AV02 714 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PRRG1O14668 218 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 MCF2LO15068 1137 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PAGE1O75459 146 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ETFBP38117 255 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CETN2P41208 172 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CXCR3P49682 368 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NOMO1Q15155 1222 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PTPRRQ15256 657 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF280DQ6N043 979 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 BBS12Q6ZW61 710 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 IQCKQ8N0W5 287 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 MPP5Q8N3R9 675 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RAB17Q9H0T7 212 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TEX28O15482 410 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TRAPPC3O43617 180 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PBX2P40425 430 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 LMAN1P49257 510 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PRMT2P55345 433 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ZXDBP98169 803 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ITIH3Q06033 890 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC14Q15048 493 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TCEAL1Q15170 157 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 STILQ15468 1287 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CYP4X1Q8N118 509 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 FNIP1Q8TF40 1166 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 OGFRQ9NZT2 677 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHB8Q9UN66 801 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NOTCH4Q99466 2003 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ANTXRLA6NF34 631 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 APOL1O14791 398 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 FAM155BO75949 473 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 DNAJB1P25685 340 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 TPI1P60174 286 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 RPS24P62847 133 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 GUCY1A3Q02108 690 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 MAP9Q49MG5 647 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 BOLA3Q53S33 107 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 CPT1BQ92523 772 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 ADAM21Q9UKJ8 722 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.8□□□□□ -1.32
CNIH1-201ENST00000216416 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms