RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000111980.3

Hoxd4-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd4, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tph2Q8CGV2 488 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 LactbQ9EP89 551 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bmp15Q9Z0L4 392 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mtm1Q9Z2C5 603 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt16Q9Z2K1 469 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Plce1Q8K4S1 2282 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcm1Q9R0L6 2025 aa20.44■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Znf518bB2RRE4 1077 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ErmardE9Q048 622 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm6588E9Q3K0 461 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fbrsl1E9Q9T0 1031 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd8aP01731 247 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Nr2c2P49117 596 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 InhbcP55104 352 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cntn5P68500 1098 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uba1Q02053 1058 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zscan2Q07230 614 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 ThrspQ62264 150 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Txndc8Q69AB2 127 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Amer3Q6NS69 780 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5622Q810Q0 167 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Unc5bQ8K1S3 945 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Epn3Q91W69 636 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chmp2aQ9DB34 222 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uchl3Q9JKB1 230 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Krt27Q9Z320 448 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 MylkQ6PDN3 1941 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam43bA2AM80 330 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hnrnph3D3Z3N4 346 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 IdsQ08890 552 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Taar7aQ5QD12 358 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cyp3a13Q64464 503 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tshz2Q68FE9 1030 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 DgkqQ6P5E8 934 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 HpseQ6YGZ1 535 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Hook3Q8BUK6 718 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tspan33Q8R3S2 283 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Emid1Q91VF5 444 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Bzw2Q91VK1 419 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Pcdhgb4Q91XX6 912 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Papd4Q91YI6 484 aa20.43■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 OtofQ9ESF1 1997 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Fam71aB7XG49 585 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AlpiF8VPQ6 554 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 AfpP02772 605 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zp3P10761 424 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 RargP18911 458 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Naf1Q3UMQ8 489 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ephx3Q3V1F8 367 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tas2r129Q7M709 320 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr867Q7TRF3 331 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ubr7Q8BU04 425 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Apol9bQ8C7I4 310 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cd207Q8VBX4 331 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ergic2Q9CR89 377 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mcur1Q9CXD6 340 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Mfap3lQ9D3X9 409 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Lat2Q9JHL0 203 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ndrg2Q9QYG0 371 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Dnajc7Q9QYI3 494 aa20.42■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Zscan5bB2RTN3 468 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 C87414E9PWI7 475 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cavin1O54724 392 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sept7O55131 436 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 EndouQ3V188 412 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Syne3Q4FZC9 975 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tbx2Q60707 711 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Rtl3Q6P1Y1 553 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Olfr213Q7TS32 327 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Prpf38bQ80SY5 542 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slu7Q8BHJ9 585 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Acsl5Q8JZR0 683 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 UvragQ8K245 698 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Elp2Q91WG4 831 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Masp2Q91WP0 685 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tc2nQ91XT6 489 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Trpc2Q9R244 1172 aa20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Uso1Q9Z1Z0 959 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cacna1eQ61290 2272 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Igkv10-95A0A0G2JFY3 115 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5415E9PXF3 478 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Slc4a5E9Q3M5 1116 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gm5814J3QP80 125 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Opn1mwO35599 359 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Ifnb1P01575 182 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gria2P23819 883 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Cfap157Q0VFX2 523 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tespa1Q3U132 458 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Tmem237Q3V0J1 427 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Chsy1Q6ZQ11 800 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Heatr3Q8BQM4 679 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Vcpip1Q8CDG3 1220 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Abcg3Q99P81 650 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Sec13Q9D1M0 322 aa20.4■□□□□ 0.86
Hoxd4-202ENSMUST00000111980 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.2 ms