RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rgs2O08849 211 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ap1g2O88512 791 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trap1aP19473 224 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Psma2P49722 234 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Col19a1Q0VF58 1136 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nt5dc3Q3UHB1 546 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mylk3Q3UIZ8 795 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rasa4Q6PFQ7 802 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slco2b1Q8BXB6 683 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 DrgxQ8BYH0 263 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tssk3Q9D2E1 268 aa23.92■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm11236J3QMS7 360 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pias1O88907 651 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdc6O89033 562 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sdr16c6Q05A13 316 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt80Q0VBK2 452 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 CcnyQ8BGU5 341 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Chmp2bQ8BJF9 213 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 AopepQ8BXQ6 817 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mkl1Q8K4J6 964 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr711Q9EPG2 314 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nfu1Q9QZ23 255 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sept5Q9Z2Q6 369 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 9330159F19RikD3Z623 648 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 E230025N22RikG5E8S3 482 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Clcn6O35454 870 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 PigrO70570 771 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rag1P15919 1040 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 AcrP23578 436 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Emilin3P59900 758 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mef2dQ63943 514 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr348Q8VGK3 313 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc65Q8VHI7 493 aa23.91■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf106O88466 1888 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 4930402K13RikB1AW18 415 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppfia4B8QI36 1187 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc6a13P31649 602 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Smad1P70340 465 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 FdpsQ920E5 353 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tspan17Q9D7W4 270 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 MajinQ9D992 256 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgef26D3YYY8 869 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdh9P70407 786 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 TceancQ3US16 359 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mapre1Q61166 268 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Aldh1a2Q62148 518 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Best2Q8BGM5 508 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcdhb17Q91VD8 799 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Npffr2Q924H0 417 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Map3k6Q9WTR2 1291 aa23.9■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dusp8O09112 663 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 P01878 344 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Msx3P70354 204 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gcnt3Q5JCT0 437 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ksr1Q61097 873 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pcsk9Q80W65 694 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 PdhxQ8BKZ9 501 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Traf3ip2Q8N7N6 555 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Q922M7 232 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fam114a1Q9D281 569 aa23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
Suds3-201ENSMUST00000086471 Sh3pxd2bA2AAY5 908 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn1r39G3UWE6 305 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nos2P29477 1144 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcm9Q2KHI9 1134 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fnip1Q68FD7 1165 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 MyorgQ69ZQ1 716 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cplx3Q8R1B5 158 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Trem2Q99NH8 227 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eef1akmt2Q9D853 244 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf654Q9DAU9 571 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pak1ip1Q9DCE5 382 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Htra2Q9JIY5 458 aa23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tespa1Q3U132 458 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Erap1Q9EQH2 930 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 GgcxQ9QYC7 757 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 JrklB2RRL2 523 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Odc1P00860 461 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Btbd1P58544 488 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r7Q3UM45 361 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Afg1lQ3V384 480 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Arhgap44Q5SSM3 814 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfr1198Q7TR12 308 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mgrn1Q9D074 532 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 ParvbQ9ES46 365 aa23.88■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Kctd18E0CZ26 429 aa23.87■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Art2bO35975 289 aa23.87■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 BtkP35991 659 aa23.87■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fut7Q11131 389 aa23.87■■□□□ 1.41
Suds3-201ENSMUST00000086471 DbhQ64237 622 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.4 ms