RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa9.57□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Malrd1A2AJX4 2123 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdh23Q99PF4 3354 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbkbp1A2A9T0 611 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700001O22RikA2APZ1 375 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rabgap1lA6H6A9 815 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10719E9Q7T3 227 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zc3h12bG3X9I7 835 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 E230025N22RikG5E8S3 482 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm21962L7N280 338 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anxa8O35640 327 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pim1P06803 397 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myl4P09541 193 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PenkP22005 268 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxd8P23463 289 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TktP40142 623 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wee1P47810 646 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt1P53368 156 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sycp3P70281 254 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TankP70347 448 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adamts1P97857 968 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 RnaselQ05921 735 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sdr16c6Q05A13 316 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kpna1Q60960 538 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptpn14Q62130 1189 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plk4Q64702 925 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kiaa1841Q68FF0 718 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 OcrlQ6NVF0 900 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DstykQ6XUX1 927 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stk40Q7TNL3 435 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Orai2Q8BH10 250 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc7a4Q8BLQ7 635 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slco2b1Q8BXB6 683 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nipal4Q8BZF2 406 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Csnk1g3Q8C4X2 424 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr27Q8C5V5 780 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Castor2Q8CAB8 329 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abi1Q8CBW3 481 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sept8Q8CHH9 429 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem259Q8CIV2 574 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ClmpQ8R373 373 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp617Q91WM0 559 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdha1Q91Y21 948 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mfsd5Q921Y4 450 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sec14l2Q99J08 403 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ophn1Q99J31 802 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adi1Q99JT9 179 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TrabdQ99JY4 376 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sike1Q9CPR7 207 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ssu72Q9CY97 194 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Iqcf1Q9D9K8 182 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mgea5Q9EQQ9 916 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kdelc1Q9JHP7 502 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 QkiQ9QYS9 341 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DgkeQ9R1C6 564 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpxm1Q9Z100 722 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Plin4O88492 1403 aa9.56□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Myo16Q5DU14 1919 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp236S4R299 1847 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2b13A6H6J2 491 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh2d4bA6X942 431 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Skint6A7XUZ6 1240 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm12800B1AUV4 484 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim30cD3YVI9 513 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm10722F6VLK5 217 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Abhd12bG3UZN6 359 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r19G5E8G4 854 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm12794L7MTS5 483 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FaahO08914 579 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nek2O35942 443 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sypl2O89104 264 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prf1P10820 554 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vav1P27870 845 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gjb3P28231 270 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smpd1Q04519 627 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700061G19RikQ08EE8 705 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bpifa6Q0VGU8 367 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb48Q1H9T6 681 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mcm9Q2KHI9 1134 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 March9Q3TZ87 348 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trmt10cQ3UFY8 414 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cnga4Q3UW12 575 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Itga1Q3V3R4 1179 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AcdQ5EE38 416 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grm6Q5NCH9 871 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr8Q60892 310 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DbhQ64237 622 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gstt1Q64471 240 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nlrp4fQ66X05 959 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prrt3Q6PE13 971 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxo6Q70KY4 559 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akap7Q7TN79 314 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Baiap2l2Q80Y61 522 aa9.55□□□□□ -0.88
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AopepQ8BXQ6 817 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.6 ms